Abundance and distribution of simple sequence repeats in the Musaceae family. Microsatellite markers to map the banana genome

Lagoda Pierre, Noyer Jean-Louis, Dambier Dominique, Baurens Franc-Christophe, Lanaud Claire. 1995. Abundance and distribution of simple sequence repeats in the Musaceae family. Microsatellite markers to map the banana genome. In : Induced mutations and molecular techniques for crop improvement = [Mutations induites et techniques moléculaires pour l'amélioration des plantes de culture]. IAEA; FAO. Vienne : IAEA, 287-295. International Symposium on the Use of Induced Mutations and Molecular Techniques for Crop Improvement, Vienne, Autriche, 19 Juin 1995/23 Juin 1995.

Autre titre : Abondance et distribution de séquences simples répétées dans la famille des Musacées. Des microsatellites comme marqueurs pour cartographier le génome bananier

Résumé : Une bibliothèque génomique de Musa, partiellement fractionnée par PstI, et précédemment établie comme source pour des marqueurs RFLP, a été recriblée quant au nombre de séquences dinucléotidiques répétées. Des résultats préliminaires sont donnés concernant les séquences microsatellites de dinucléotides dans le génome bananier. Approximativement un sixième (17 pour cent) des clones de la bibliothèque des gènes bananiers contient au moins un site de microsatellite, comme le confirme le séquençage. Etonnamment, la majorité des séquences répétées dinucléotidiques sont de la famille des séquences (GA)n. Ces microsatellites récemment développés comme marqueurs sur le bananier se sont révélés être abondants et polymorphes (le nombre d'allèles par locus variant entre 11 et 24 sur un échantillon test de 19 accessions représentant les différentes sections de la famille des Musacées). Des protocoles de laboratoire ont été simplifiés, et une procédure d'analyse non radioactive et à haute résolution a été adaptée afin de détecter les allèles des séquences de nombre variable répétées en tandem. Ceci permettra de promouvoir l'exportation des microsatellites comme marqueurs vers les pays en voie de développement

Mots-clés Agrovoc : Musaceae, séquence nucléotidique, marqueur génétique, carte génétique, génome, RFLP, PCR, Rhammatocerus schistocercoides

Mots-clés complémentaires : Prionyx thomae

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes

Auteurs et affiliations

• Lagoda Pierre
• Noyer Jean-Louis ORCID: 0000-0002-7389-5621
• Dambier Dominique ORCID: 0000-0002-9117-8853
• Baurens Franc-Christophe ORCID: 0000-0002-5219-8771
• Lanaud Claire ORCID: 0000-0001-6411-7310

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/388207/)

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