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Evaluation de la méthode Biolog (profils d'assimilation de substrats carbonés) pour l'identification de Xanthomonas spp. pathogènes sur agrumes et la mise en évidence de variabilité chez X. campestris pv. citri

Pruvost Olivier, Hartung J.S., Vernière Christian, Jacquemoud-Collet Jean-Pierre, Gambin Olivier, Devaux M., Luisetti Jacques, Civerolo E.L.. 1993. Evaluation de la méthode Biolog (profils d'assimilation de substrats carbonés) pour l'identification de Xanthomonas spp. pathogènes sur agrumes et la mise en évidence de variabilité chez X. campestris pv. citri. In : Journées FLHOR vergers tropicaux = FLHOR seminar on tropical orchards$ENG. CIRAD-FLHOR. Montpellier : CIRAD-FLHOR, pp. 77-78. Réunion annuelle CIRAD-FLHOR, Montpellier, France, 30 August 1993/5 September 1993.

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Titre anglais : Assessment of the Biolog technique (assimilation profiles on carbon substrates) to identify Xanthomonas spp. pathogens on citrus while highlighting variability in X. campestris pv. citri / Titre français : Evaluacion del metodo Biolog (perfiles de asimilacion de susbtratos carbonados) para la identificacion de Xanthomonas spp. patogenos sobre citricos y la puesta en evidencia de la variabilidad en X. campestris pv. citri

Abstract : Les profils d'assimilation de 95 substrats carbonés ont été obtenus par la technique Biolog pour 148 souches des pathotypes de X. campestris pv. citri provoquant le chancre bactérien des agrumes et pour 43 souches de X. campestris provoquant le "citrus bactérial spot". Ces profils métaboliques ont servi de données de base pour identifier toutes ces souches bactériennes à l'aide de la base de données inclue dans le logiciel Microlog. Or, il y a eu un faible taux de reconnaissance. La base commerciale Microlog enrichie de données provenant de souches de X. c. pv. citri et de souches de X. campestris a permis l'identification de 64% de souches de X. campestris et de 70% de souches de X. c. pv. citri. Au vu de ces résultats, l'utilisation de cette méthode est à préconiser seulement en association avec d'autres méthodes de diagnostic

Mots-clés Agrovoc : Citrus, Xanthomonas campestris, Bacteria, Maladie des plantes, Métabolisme, Identification, Logiciel, Banque de données

Classification Agris : H20 - Plant diseases

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Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/467382/)

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