Motamayor Juan Carlos. 2001. Etude de la diversité génétique et de la domestication des cacaoyers du groupe Criollo (Theobroma cacao L.) à l'aide de marqueurs moléculaires. Orsay : Université de Paris-Sud, 179 p. Thèse de doctorat : Sciences de la vie : Université de Paris-Sud
Encadrement : Lanaud, Claire
Résumé : Des prospections réalisées dans cinq pays d'Amérique Latine ont permis d'échantillonner et de collecter des cacaoyers appartenant au groupe Criollo. Parmi les sites collectés se trouvent, la forêt Lacandona (Mexique) d'où l'on pensait que le groupe Criollo était originaire et des sites archéologiques du Yucatan (Mexique) où les Mayas cultivaient le cacaoyer. Au moyen de marqueurs RFLP, AFLP et microsatellites, une très faible diversité génétique a été trouvée au sein des Criollo non introgressés par des gènes de Forastero (Criollo Anciens). Les distances génétiques observées entre les individus Criollo Anciens et des individus sauvages de Colombie et d'Equateur sont apparues inférieures ou au moins équivalentes aux distances génétiques observées entre ces derniers et d'autres individus Forastero d'Amérique du Sud. Ceci nous a amené à proposer que la variété traditionnelle Criollo ne représente pas une sousespèce de Theobroma cacao L. totalement différencié des populations de cacaoyers d'Amérique du Sud (contrairement à ce qui était généralement avancé), mais plutôt une population de plus au sein d'une espèce génétiquement très diverse. Nos résultats suggèrent également une origine sud-américaine des Criollo. On a pu aussi identifier les parents Forastero à l'origine des Trinitario. La diversité allélique de ce groupe peut être observée en seulement deux individus Criollo Anciens et trois individus Forastero de Basse Amazonie. La combinaison d'un seul génotype Criollo Ancien et d'un seul génotype bas amazonien explique la variabilité moléculaire de 50% des Trinitario analysés provenant de 16 pays. Peu de diversité mitochondriale a été observée entre les différents individus Criollo, Trinitario et Forastero analysés. On a pu montrer la transmission maternelle prépondérante des mitochondries mais aussi une transmission à travers le pollen plus réduite. Des variations stoechiométriques de différents génomes mitochondriaux entre individus d'une même descendance ont aussi été observés. La participation de gènes nucléaires dans la régulation de ces variations stoechiométriques a pu être montrée et ces gènes cartographiés. Enfin, une recherche bibliographique approfondie sur l'utilisation du cacao par les civilisations du sud-ouest du Venezuela à l'arrivée des Espagnols a permis de conforter les résultats moléculaires qui suggèrent l'origine sud-américaine des cacaoyers Criollo.
Mots-clés Agrovoc : Theobroma cacao, variation génétique, domestication, marqueur génétique, adn
Mots-clés géographiques Agrovoc : Amérique latine
Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
Auteurs et affiliations
- Motamayor Juan Carlos, Université de Paris-Sud (FRA)
Autres liens de la publication
Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/484729/)
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