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Genetic diversity of taro (Colocasia esculenta (L.) Schott) assessed by SSR markers

Noyer Jean-Louis, Billot Claire, Brottier Philippe, Quéro Garcia José, Lebot Vincent. 2004. Genetic diversity of taro (Colocasia esculenta (L.) Schott) assessed by SSR markers. In : Third Taro Symposium, 21-23 May 2003, Nadi, Fiji Islands : proceedings of an international scientific meeting. Guarino Luigi (ed.), Taylor Mary B. (ed.), Osborn Tom (ed.). SPC, IPGRI. Suva : SPC, pp. 174-180. ISBN 982-00-0027-0 Taro Symposium. 3, Nadi, Fidji, 21 May 2003/23 May 2003.

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Titre français : Etude de la diversité génétique du taro (Colocasia esculenta (L.) Schott) par analyse de marqueurs SSR

Abstract : Le criblage de 96 clones extraits d'une banque enrichie en marqueurs microsatellites a permis d'isoler 49 séquences contenant des motifs répétés. Quinze paires d'amorce ont été créées. Toutes ont révélé un polymorphisme (nombre d'allèles compris entre 2 et 8) dans un sous-ensemble de cinq obtentions de taro. Sept paires d'amorce ont été utilisées pour étudier la diversité génétique de 105 obtentions, et ont permis de révéler 100 allèles. Cet échantillon a été constitué pour couvrir toute la diversité génétique de Colocasia esculenta telle que décrite par des membres du Réseau de recherche sur le taro pour l'Asie du Sud-Est et l'Océanie (TANSAO) à l'aide de marqueurs AFLP. Des dendogrammes ont été réalisés grâce à la méthode NJTree (Neighbor Joining Method) fondée sur une matrice de similitude calculée selon un indice de Dice. Le niveau d'hétérosygotie a été calculé malgré la présence d'obtentions diploïdes et triploïdes. Les résultats sont décrits et commentés. (Résumé d'auteur)

Mots-clés Agrovoc : Colocasia esculenta, Variation génétique, Distance génétique, Marqueur génétique, Microsatellite, Hétérozygote, Polymorphisme génétique

Mots-clés complémentaires : AFLP

Classification Agris : F30 - Plant genetics and breeding

Auteurs et affiliations

  • Noyer Jean-Louis, CIRAD-AMIS-BIOTROP (FRA) ORCID: 0000-0002-7389-5621
  • Billot Claire, CIRAD-AMIS-BIOTROP (FRA)
  • Brottier Philippe, Centre national de séquençage (FRA)
  • Quéro Garcia José, CIRAD-CA-CALIM (FRA)
  • Lebot Vincent, CIRAD-CA-CALIM (VUT)

Autres liens de la publication

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/518607/)

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