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Analyse de la diversité et évaluation du déséquilibre de liaison chez quelques populations naturelles et cultivées de caféiers Coffea canephora

Cubry Philippe. 2005. Analyse de la diversité et évaluation du déséquilibre de liaison chez quelques populations naturelles et cultivées de caféiers Coffea canephora. Montpellier : ENSAM, 27 p. Mémoire DEA : Ressources génétiques et interactions biologiques : Ecole nationale supérieure agronomique de Montpellier

Disertation
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Titre anglais : Genetic diversity analyses and linkage disequilibrium evaluation in some natural and cultivated populations of Coffea canephora

Abstract : Le café Robusta, produit par Coffea canephora, représente environ 35% de la production mondiale de café. Dans le cadre de recherches visant à l'amélioration de la qualité à la tasse du café, la connaissance de la diversité génétique des populations naturelles et cultivées présente un intérêt important. Dans un premier temps, une étude de diversité a été réalisée à l'aide de 34 marqueurs SSR répartis sur l'ensemble du génome. Cette étude comprend des populations d'individus des grands groupes génétiques préalablement identifiés ainsi que des populations sauvages et cultivées d'Afrique de l'Est jamais analysées pour leur diversité. Les résultats obtenus confirment la structuration en groupes décrite précédemment et indiquent l'originalité des populations d'Afrique de dans l'espèce Coffea canephora. Ces populations pourraient constituer une variabilité génétique utilisable par les sélectionneurs. Une évaluation du déséquilibre de liaison pour des marqueurs entre lesquels la distance génétique est connue a ensuite été menée pour 25 marqueurs microsatellites sur les populations analysées en diversité. Les résultats de cette étude pourront être utilisés pour les programmes d'amélioration des populations en cours et serviront de base à la définition de populations utilisables pour de futures études d'association. (Résumé d'auteur)

Mots-clés Agrovoc : Coffea canephora, Variation génétique, Marqueur génétique, Microsatellite, Organisme indigène, Population végétale, Amélioration des plantes, Plante de culture, Plante sauvage, Génétique des populations, Ressource génétique, Liaison génétique

Mots-clés géographiques Agrovoc : Afrique orientale, Congo, Ouganda, Guinée

Mots-clés complémentaires : SSR, Linkage disequilibrium

Classification Agris : F30 - Plant genetics and breeding
F70 - Plant taxonomy and geography

Auteurs et affiliations

  • Cubry Philippe, CIRAD-AMIS-UMR PIA (FRA)

Autres liens de la publication

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/527827/)

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