Les populations de Cymbidium mosaic virus (CymMV, Protexvirus) sont divisées en deux haplogroupes en expansion

Moles Marion, Delatte Hélène, Farreyrol Karin, Grisoni Michel. 2007. Les populations de Cymbidium mosaic virus (CymMV, Protexvirus) sont divisées en deux haplogroupes en expansion. In : 11 èmes Rencontres de virologie végétale, Aussois, 28 janvier au 1er février 2007. s.l. : s.n., 1 p. Rencontres de virologie végétale. 11, Aussois, France, 28 Janvier 2007/1 Février 2007.

Résumé : La diversité génétique du Cymbidium mosaic virus (CymMV, Flexiviridae) a été analysée à partir des séquences de deux gènes; RNA polymérase (RdRp, 37 séquences) et protéine de capside (CP, 85 séquences). La population de CymMV a une diversité nucléotidique modérée (p=0.053 et p=0.054 pour les gènes de RdRp et CP respectivement) mais est divisée en deux groupes phylogénétiques bien distincts (CymMV-A et CymMV-B). Ces deux groupes diffèrent également par le biais d'usage des codons et la structure secondaire des ARN. La majorité des différences nucléotidiques inter groupes est constituée de mutations silencieuses répartie uniformément le long des gènes étudiés. De ce fait, les séquences en acides aminés sont peu divergentes (86 à 100 % d'identité) et les deux groupes d'isolats indiscernables au niveau protéique. L'analyse des paramètres de génétique des populations montre que les deux gènes étudiés sont soumis à une forte pression de sélection (Ka/Ks = 0.009 et 0.040 pour les gènes RdRp et CP, respectivement) et suggère une forte expansion des populations de CymMV. Les isolats de CymMV qui infectent les orchidées cultivées paraissent donc avoir une origine duale et être issus de deux goulots d'étranglement. L'éventualité de propriétés biologiques différentes pour les deux groupes d'isolats reste à déterminer.

Classification Agris : H20 - Maladies des plantes

Auteurs et affiliations

• Moles Marion
• Delatte Hélène, IRD (FRA)
• Farreyrol Karin, University of Auckland (NZL)
• Grisoni Michel, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU) ORCID: 0000-0001-9867-9098

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/541627/)

Métriques

[ Page générée et mise en cache le 2024-03-24 ]