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Fréquence de mutation et production de molécules défectives chez le Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV)

Urbino Cica, Granier Martine, Macia Jean Luc, Froissart Rémi, Blanc Stéphane, Peterschmitt Michel. 2007. Fréquence de mutation et production de molécules défectives chez le Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV). In : 11 èmes Rencontres de virologie végétale, Aussois, 28 janvier au 1er février 2007. s.l. : s.n., Résumé, p. 84. Rencontres de virologie végétale. 11, Aussois, France, 28 January 2007/1 February 2007.

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Abstract : La capacité d'adaptation des virus est en grande partie liée à un taux de mutation très élevé et aussi, chez certains virus, à la recombinaison. Ces phénomènes sont pourtant très mal caractérisés chez les phytovirus et tout particulièrement chez les virus à ADN simple brin qui utilisent une ADN polymérase cellulaire pour leur réplication. Contrairement aux polymerases (RdRp) de virus à ARN, qui sont connues pour avoir un taux d'erreur très élevé, les ADN polymerases de l'hôte sont très fidèles durant le cycle cellulaire classique. Cependant, nos résultats précédents, obtenus sur des isolats de géminivirus du maïs, le Maize streak virus (Isnard et al. 1998) et des analyses de séquences effectuées par d'autres suggèrent que le taux de mutation des virus qui les utilisent est élevé. Cela reste un paradoxe qui doit être étayé de manière expérimentale. Nous avons mesuré la fréquence de mutation au sein d'une population virale issue d'une plante inoculée avec un clone de Tomato yellow leaf curl virus (TYLCV, famille Geminiviridae, genre Begomovirus), soit une séquence unique. Après infection systémique, les ADNs viraux sont extraits et clonés directement sans étape d'amplification préalable. Onze clones ont été entièrement séquencés, 9 sont des génomes entiers (2,8kb) et 2 sont des génomes défectifs (environ 1,3kb). Une fréquence de mutations de 1.6 10-4 a été calculée sur la base de 25 000 nucléotides séquencés. Cette fréquence de mutation est proche de celles des virus à ARN. Elle est largement supérieure à la fréquence de mutation théoriquement engendrée par des ADN polymérases cellulaires, ce qui confirme expérimentalement le paradoxe cité ci-dessus et pose question sur les raisons d'une modification de fidélité de ces polymerases cellulaires dans un contexte d'infection par un géminivirus. Les molécules défectives ont une structure surprenante; elles sont constituées d'une mosaïque de fragments du génome du clone de TYLCV inoculé. Une des molécules défectives contient un fragment d'origine inconnu. Des erreurs de réplication impliquant des phénomènes de recombinaison multiples sont très certainement en cause, mais la genèse de ces molécules reste à ce jour difficile à expliquer. (Texte intégral)

Mots-clés Agrovoc : Géminivirus enroulement jaune tomat, Infection expérimentale, Génie génétique, Génétique moléculaire, Mutation, Solanum lycopersicum, Clonage moléculaire

Mots-clés complémentaires : Tomato yellow leaf curl virus

Classification Agris : H20 - Plant diseases
F30 - Plant genetics and breeding

Auteurs et affiliations

  • Urbino Cica, CIRAD-PERSYST-UPR Horticulture (FRA)
  • Granier Martine, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (FRA)
  • Macia Jean Luc
  • Froissart Rémi
  • Blanc Stéphane
  • Peterschmitt Michel, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (FRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/541713/)

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