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La séquence du génome de Xanthomonas albilineans dévoile des particularités surprenantes chez cette bactérie pathogène de la canne à sucre

Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Véronique, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2008. La séquence du génome de Xanthomonas albilineans dévoile des particularités surprenantes chez cette bactérie pathogène de la canne à sucre. In : 8èmes Rencontres plantes-bactéries,14-18 janvier 2008, Aussois, France. s.l. : s.n., p. 11. Rencontres plantes-bactéries. 8, Aussois, France, 14 January 2008/18 January 2008.

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Abstract : Xanthomonas albilineans est l'agent causal de I'échaudure des feuilles de la canne à sucre. Cette bactérie produit une toxine particulière et spécifique, appelée albicidine, qui joue un rôle clé dans l'apparition des symptômes foliaires. Le génome de la souche PC73 (= CFBP7063) de X. albilineans, originaire de Guadeloupe, a été séquencé et annoté. Il comprend un chromosome circulaire de 3,7 Mb et trois plasmides (25, 27 et 32 kb). Cette taille du génome est nettement inférieure à celle des autres espèces de Xanthomonas (environ 5 Mb) séquencées à ce jour. Contrairement aux autres Xanthomonas, X. albilineans ne possède pas d'injectisome (ou système de sécrétion de type III de la famille Hrp2) impliqué dans les interactions avec la plante hôte. L'analyse de la séquence du génome de la souche PC73 de X. albilineans révèle que X. albilineans se distingue des autres bactéries phytopathogènes par sa capacité à produire des métabolites secondaires. En effet cette souche possède, en plus du groupement de gènes impliqués dans la biosynthèse de l'albicidine, trois autres groupements de gènes de la famille des peptides synthétases non ribosomales (NRPS). Les analyses in silico ont permis de montrer que les peptides synthétisés par ces trois nouveaux groupements de gènes NRPS ne ressemblent à aucun autre peptide décrit à ce jour. L'implication de métabolites secondaires dans la pathogenèse de X. albilineans pourrait expliquer l'absence d'injectisome Hrp2. En effet, ces métabolites secondaires, qui n'ont besoin que de pompes pour sortir de la bactérie et pour entrer dans la cellule végétale, pourraient agir comme des effecteurs. Le groupement de gènes rpf ("regulation of pathogenicity factors") impliqué dans la biosynthèse et la perception du DSF ("diffusible signal factor") qui est présent dans le génome des autres Xanthomonas phytopathogènes est conservé dans le génome de la souche PC73. La taille réduite du génome de X. albilineans et ses autres particularités suggèrent que cette espèce est un intermédiaire au cours de l'évolution du genre Xanthomonas. (Résumé d'auteur)

Mots-clés Agrovoc : Xanthomonas albilineans, Saccharum

Mots-clés géographiques Agrovoc : Guadeloupe

Mots-clés complémentaires : Albicidine

Classification Agris : H20 - Plant diseases

Auteurs et affiliations

  • Pieretti Isabelle, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (FRA)
  • Royer Monique, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (FRA)
  • Barbe Valérie, Centre national de séquençage (FRA)
  • Carrère Sébastien, INRA (FRA)
  • Koebnik Ralf, IRD (FRA)
  • Cociancich Stéphane, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (FRA)
  • Couloux Arnaud, Centre national de séquençage (FRA)
  • Darrasse Armelle, INRA (FRA)
  • Gouzy Jérôme, INRA (FRA)
  • Jacques Marie Agnès, INRA (FRA)
  • Lauber Emmanuelle, INRA (FRA)
  • Manceau Charles, INRA (FRA)
  • Mangenot Sophie, Centre national de séquençage (FRA)
  • Poussier Stéphane, INRA (FRA)
  • Segurens Béatrice, Centre national de séquençage (FRA)
  • Szurek Boris, IRD (FRA)
  • Verdier Véronique, IRD (FRA)
  • Arlat Mathieu, INRA (FRA)
  • Rott Philippe, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (USA) ORCID: 0000-0001-6085-6159

Autres liens de la publication

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/547744/)

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