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Análise in silico da expressão gênica de citocromo p450 relacionada ao metabolismo de diterpenos em Coffea : [Resumo]

Ivamoto Suzana Tiemi, Pot David, Ferreira Lucia Pires, Alves L.C., Domingues Douglas S., Vieira Luiz Gonzaga Esteves, Pereira Luiz Filipe P.. 2010. Análise in silico da expressão gênica de citocromo p450 relacionada ao metabolismo de diterpenos em Coffea : [Resumo]. In : Resumos do 56° Congresso Brasileiro de Genética, 14 a 17 de setembro de 2010, Guaruja, Brasil. Sociedade Brasileira de Genética. s.l. : s.n., 252. Congresso Brasileiro de Genética. 56, Guaruja, Brésil, 14 Septembre 2010/17 Septembre 2010.

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Résumé : O Brasil é o maior produtor e exportador de café mundial, além de possuir o segundo maior mercado consumidor. Estudos para melhorar geneticamente a qualidade da bebida e resistência da planta são cada vez mais frequentes e de fundamental importância. Os diterpenos presentes na fração lipídica do grão de café, como o cafestol e o caveol, estão diretamente ligados tanto a propriedades nutracêuticas da bebida como a mecanismos de defesa da planta. O estudo dos genes que controlam a biossíntese dos diterpenos são importantes para compreender as vias metabólicas e as enzimas que controlam o acúmulo/degradação dos mesmos. Os genes da cyt P450 são de uma família multigênica, cujos muitos membros estão envolvidos no metabolismo secundário das plantas, inclusive na síntese de diterpenos. O presente trabalho visa identificar e caracterizar in silico genes de citocromo P450 (Cyt P450) a partir de seqüências ESTs disponibilizadas em projetos de transcriptoma do cafeeiro, com ênfase na identificação de genes candidatos envolvidos no metabolismo de cafestol e caveol. Foram selecionadas 1396 seqüências, provenientes do projeto brasileiro Genoma Café, disponibilizado no banco de dados do LGE Campinas (http://www.lge.ibi.unicamp. br/cafe) e da Universidade de Cornell (LIN et al., 2005). Foram formados 92 contigs e 65 singlets, utilizando-se o programa Codon Code Aligner. Os 92 contigs analisados por BLAST X contra bancos de dados de seqüências públicos (GenBank e HarvEST Coffea), confirmando-se para 91 contigs sua identidade com genes de Cyt P450. A análise in silico por Northen eletrônico revelou níveis e perfis de expressão específicos para cada um dos contigs, permitindo assim a seleção de alguns genes candidatos para análises transcricionais baseados nas diferenças de expressão entre bibliotecas de cDNA com diferentes tecidos (flor, fruto, folha, raiz, etc), e também sob diferentes condições fisiológicas (estressados e não estressados). O presente estudo serve de plataforma para a análise de expressão de cyt P450 candidatas em amostras de RNA de tecidos contrastantes para acúmulo de caveol e cafestol, além de frutos tratados com metil jasmonato, por diferentes metodologias, como o microarranjo (NimbleGen) e por RT-PCR. Apoio financeiro: CNPq e CBP&Café. (Texte intégral)

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
F60 - Physiologie et biochimie végétales

Auteurs et affiliations

  • Ivamoto Suzana Tiemi, UEL (BRA)
  • Pot David, CIRAD-BIOS-UMR DAP (FRA) ORCID: 0000-0001-6144-8448
  • Ferreira Lucia Pires, IAC [Instituto Agronomico] (BRA)
  • Alves L.C., IAPAR (BRA)
  • Domingues Douglas S., IAPAR (BRA)
  • Vieira Luiz Gonzaga Esteves, IAPAR (BRA)
  • Pereira Luiz Filipe P., IAPAR (BRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/558728/)

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