Identificação e caracterização de genes órfãos ("no hits") de café (Coffea canephora ), envolvidos na resposta à seca : [n. 311]

Duarte Karoline Estefani, Gomes Vieira Natalia, Martins Polyana Kelly, Ribeiro Ana Paula, Da Cunha Bárbara Andrade D. B., Molinari Hugo Bruno Correa, Kobayashi Adilson Kenji, Marraccini Pierre, Carvalho Andrade Alan. 2013. Identificação e caracterização de genes órfãos ("no hits") de café (Coffea canephora ), envolvidos na resposta à seca : [n. 311]. In : VIII Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil, 25 a 28 de novembro de 2013, Salvador, Brasil. s.l. : s.n., 6 p. Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil. 8, Salvador, Brésil, 25 Novembre 2013/28 Novembre 2013.

Titre anglais : Identification and characterization of ophan genes ("no hits") in coffee (Coffea canephora), involved in drought-stress responses

Résumé : O café é uma planta perene, sendo considerada uma das commodities agrícolas mais importantes do mundo. Por consequencia, visando-se o estabelecimento de ferramentas de auxílio para se acelerar o melhoramento genético desta espécie, avanços significativos em genômica do cafeeiro têm ocorrido nos últimos anos. Como exemplo, pode-se citar a recente conclusão do sequenciamento do genoma completo de Coffea canephora, que servirá de referência para utilização em trabalhos avançados de genética molecular, aplicados diretamente ao melhoramento genético desta espécie, tais como o estabelecimento de programas de seleção genômica ampla (SGA) em cafeeiro. Análises recentes de bioinformática dos genomas completos de plantas indicam que cerca de 20-30% do total de genes de cada genoma são inéditos e específicos de cada espécie. Ou seja, essas sequencias genicas não apresentam similaridade alguma com as já depositadas nas bases de dados mundiais e são comumente denominadas de "no hits". Conceitos recentes, denominam esses "no hits" como "genes órfãos" e postulam que o surgimento dos mesmos são resultantes de respostas adaptativas específicas de cada espécie em função de estresses e condições adversas por essas enfrentadas, durante o processo evolutivo. Nosso trabalho está focado na identificação e caracterização funcional dos genes órfãos de café, por apresentarem alto potencial de inovação e aplicação biotecnológica. O presente estudo apresenta dados obtidos para alguns desses genes orfãos, denominados de CcUnk (Unknown), previamente identificados no genoma de C. canephora e com foco especial àqueles CcUnk genes potencialmente envolvidos na resposta à seca.

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
H50 - Troubles divers des plantes
F60 - Physiologie et biochimie végétale

Auteurs et affiliations

• Duarte Karoline Estefani, EMBRAPA (BRA)
• Gomes Vieira Natalia
• Martins Polyana Kelly, EMBRAPA (BRA)
• Ribeiro Ana Paula, EMBRAPA (BRA)
• Da Cunha Bárbara Andrade D. B., EMBRAPA (BRA)
• Molinari Hugo Bruno Correa, EMBRAPA (BRA)
• Kobayashi Adilson Kenji, EMBRAPA (BRA)
• Marraccini Pierre, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (BRA) ORCID: 0000-0001-7637-6811
• Carvalho Andrade Alan, EMBRAPA (BRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/571939/)

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