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Identificação e caracterização de genes associados à recepção e transdução do sinal de aba em Coffea sp : [n. 279]

Guitton Cotta Michelle, Marraccini Pierre, This Dominique, Leroy Thierry, Bocs Stéphanie, Dereeper Alexis, Lashermes Philippe, Carvalho Andrade Alan. 2013. Identificação e caracterização de genes associados à recepção e transdução do sinal de aba em Coffea sp : [n. 279]. In : VIII Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil, 25 a 28 de novembro de 2013, Salvador, Brasil. s.l. : s.n., 6 p. Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil. 8, Salvador, Brésil, 25 November 2013/28 November 2013.

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Titre anglais : Identification and characterization of genes involved in the recognition of the aba and the signal transduction in Coffea sp

Abstract : O gênero Coffea representa a principal commodity agrícola do mundo. Atualmente, o déficit hídrico e as elevadas temperaturas são os principais fatores abióticos responsáveis pelo declínio na produção. Tais variações ambientais também influenciam a composição bioquímica de grãos e afetam diretamente a qualidade da bebida. A variabilidade genética natural presente no gênero Coffea pode ser usada para aumentar a tolerância à seca e gerar variedades cafeeiras melhor adaptadas às variações climáticas. O ácido abscísico (ABA) é um hormônio vegetal que age como regulador central na resposta das plantas ao déficit hídrico. Recentemente, novos receptores intracelulares de ABA (PYR/PYL/RCARs) envolvidos na detecção e sinalização desse hormônio têm sido identificados e caracterizados em diversas espécies de plantas. O mecanismo de transdução de sinal de ABA proposto envolve os receptores PYR/PYL/RCARs que interagem com as proteínas fosfatases (PP2Cs) e quinases (SnRK2s). O objetivo do presente trabalho foi identificar e caracterizar os genes ortólogos desse sistema tripartite em Coffea sp. Para isso, as sequências protéicas de Arabidopsis, citros, arroz, uva e tomate foram selecionadas como sequências-alvo para a busca dos genes de café em bancos de sequências. 51 sequências das proteínas PYR/PYL/RCAR oriundas dessas espécies modelo permitiram identificar 9 sequências de receptores do ABA em Coffea sp. Do mesmo modo, 40 e 29 sequências permitiram identificar 6 e 9 sequências ortólogas das proteínas PP2Cs e SnRK2, respectivamente, em Coffea sp. Os 24 genes isolados que compõe o sistema tripartite da via de resposta a ABA em café apresentam expressão in silico diferencial em tecidos como folhas, sementes, raízes e órgãos florais. Polimorfismos foram encontrados entre os genes ortólogos e homoeólogos. No genoma de C. arabica foi possível identificar variações na sequência dos dois subgenomas diplóides ancestrais, C. canephora (CaCc) e C. eugenioides (CaCe). Análises futuras permitirão predizer o efeito funcional desses polimorfismos nas estruturas protéicas em diferentes espécies do cafeeiro. Todas essas evidencias são essenciais para elucidar o determinismo genético de tolerância à seca bem como contribuir para a obtenção de marcadores moleculares que poderão ser usados em programas de melhoramento. (Résumé d'auteur)

Classification Agris : F30 - Plant genetics and breeding
H50 - Miscellaneous plant disorders
F60 - Plant physiology and biochemistry

Auteurs et affiliations

  • Guitton Cotta Michelle, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • Marraccini Pierre, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (BRA) ORCID: 0000-0001-7637-6811
  • This Dominique, Montpellier SupAgro (FRA)
  • Leroy Thierry, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • Bocs Stéphanie, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA) ORCID: 0000-0001-7850-4426
  • Dereeper Alexis, IRD (FRA)
  • Lashermes Philippe, IRD (FRA)
  • Carvalho Andrade Alan, EMBRAPA (BRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/571961/)

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