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Análise preliminar para integração do perfil genômico e proteômico de raízes de Coffea canephora submetidos a diferentes condições hídricas : [n. 312]

Santos Costa Tatiana, Melo Jorge Alex Taquita, De Araújo Carneiro Fernanda, Araújo de Lima Edriana, Da Silva Rêgo Erica Cristina, Bloch Carlos J., Marraccini Pierre, Carvalho Andrade Alan. 2013. Análise preliminar para integração do perfil genômico e proteômico de raízes de Coffea canephora submetidos a diferentes condições hídricas : [n. 312]. In : VIII Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil, 25 a 28 de novembro de 2013, Salvador, Brasil. s.l. : s.n., 4 p. Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil. 8, Salvador, Brésil, 25 November 2013/28 November 2013.

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Titre anglais : Preliminary analysis for integrating genomic and proteomic profiling of roots of Coffea canephora subjected to different water conditions

Abstract : O café é uma das principais commodities agrícolas do mundo, sendo o Brasil o maior produtor e o segundo maior consumidor. A seca é o principal fator limitante à produção do café no país. O crescimento das plantas em condições de seca é influenciado por alterações na fotossíntese, respiração, translocação, absorção de íons, o metabolismo de nutrientes e hormônios. O objetivo deste trabalho foi avaliar a expressão gênica e proteica em raízes de clones de C. canephora var. Conilon, cultivados em condições controle e sob estresse hídrico. Os clones avaliados foram o clone 22 (sensível à seca) e os clones 14, 73 e 120 (tolerantes à seca), cultivados em condições controladas (casa de vegetação) com (I) e sem (NI) irrigação. Para cada clone e regime hídrico, foi extraído o RNA total. O perfil do transcriptoma das raízes foi realizado utilizando o sequenciamento 454, o que possibilitou análises in silico da expressão por Northern eletrônico entre os clones e comparando as condições I vs. NI. As análises proteômicas foram realizadas por LC-MSE utilizando cromatografia líquida de fase reversa acoplada à espectrometria de massa. Os resultados de identificação proteica foram obtidos com o software "Protein Lynx". Os resultados obtidos pelas análises integradas de duas dehidrinas CcDH1a e CcDH3 são apresentados. Os resultados mostram que existem diferenças entre as técnicas utilizadas, bem como no comportamento dos clones em relação às condições de estresse. As análises de expressão por qPCR em tempo real foram realizadas para validar os níveis de expressão gênica obtido pelas análises in silico. (Résumé d'auteur)

Classification Agris : F30 - Plant genetics and breeding
H50 - Miscellaneous plant disorders
F60 - Plant physiology and biochemistry

Auteurs et affiliations

  • Santos Costa Tatiana
  • Melo Jorge Alex Taquita, EMBRAPA (BRA)
  • De Araújo Carneiro Fernanda
  • Araújo de Lima Edriana, CNPq (BRA)
  • Da Silva Rêgo Erica Cristina
  • Bloch Carlos J., EMBRAPA (BRA)
  • Marraccini Pierre, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (BRA) ORCID: 0000-0001-7637-6811
  • Carvalho Andrade Alan, EMBRAPA (BRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/571968/)

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