Recherche de déterminants de la spécificité d'hôte chez X. axonopodis pv. Phaseoli : Session 2- Evolution et plasticité des génomes bactériens

Serres-Giardi Laurana, Chen Nicolas W.G., Briand Martial, Darrasse Armelle, Gagnevin Lionel, Koebnik Ralf, Noel Laurent D., Jacques Marie Agnès. 2014. Recherche de déterminants de la spécificité d'hôte chez X. axonopodis pv. Phaseoli : Session 2- Evolution et plasticité des génomes bactériens. In : 11èmes Rencontres Plantes-Bactéries, Aussois, France, 3-7 février 2014. SFP ; INRA ; CNRS ; IRD ; CIRAD. Paris : SFP, Résumé, 29. Rencontres plantes-bactéries. 11, Aussois, France, 3 Février 2014/7 Février 2014.

Résumé : Les bactéries phytopathogènes du genre Xanthomonas sont capables d'infecter une très large gamme de plantes aussi bien monocotylédones que dicotylédones. Au niveau infrasubspécifique chaque pathovar n'est capable d' infecter qu'une ou quelques espèces de plantes ce qui indique une forte spécificité d' hôte au sein du genre Xanthomonas. Des approches avec a priori, basées sur l'ana lyse de gènes classiquement décrits dans les interactions plantes-pathogènes (effecteurs de type 3, adhésines...) indiquent que chaque pathovar de Xanthomonas possède un répertoire de gènes corrélé à son hôte d'iso lement (Hajri el al, 2009 ; Mhedbi-Hajri el al, 201 1). Les souches de X . axonopodis pv. phaseoli, agent de la graisse commune du haricot commun. se répartissent en quatre lignées génétiques distinctes parfois éloignées phylogénétiquement mais appartenant toutes à l'espèce X. axonopodis telle que décrite par Vauterin et ses collègues en 1995. La capacité qu'ont ces lignées génétiques à infecter le haricot commun correspond donc à une convergence fonctionnelle qui peut être due. au ni veau moléculaire. à des évènements de convergence évolutive et/ou de transferts horizontaux entre ces lignées génétiques. Le séquençage récent de 75 génomes représentatifs de la diversité du genre Xanthomonas nous a permis de rechercher les déterminants génétiques de la spécificité d' hôte de X . axonopodis pv. phaseoli par des approches bio informatiques sans a priori focalisées sur la détection i) de motifs nucléotidiques, et ii) de répertoires de gènes, communs aux quatre lignées génétiques. Ces approches nous ont permis de générer une liste de gènes spécifiques des souches infectant le haricot commun, et de dresser un bilan global des évènements ayant potentiellement conduit à la spécialisation de ces souches à leur plante hôte (mutations. transferts horizontaux. pertes et gains de fonctions...). Nous discutons de l'utilisation potentielle de ces résultats dans la lutte contre la graisse commune du haricot commun (épidémiosurveillance, recherche de résistances durables). (Texte intégral)

Classification Agris : H20 - Maladies des plantes
F30 - Génétique et amélioration des plantes

Auteurs et affiliations

• Serres-Giardi Laurana, INRA (FRA)
• Chen Nicolas W.G., Université d'Angers (FRA)
• Briand Martial, INRA (FRA)
• Darrasse Armelle, INRA (FRA)
• Gagnevin Lionel, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU)
• Koebnik Ralf, IRD (FRA)
• Noel Laurent D., INRA (FRA)
• Jacques Marie Agnès, INRA (FRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/572831/)

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