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Whole chloroplast genomes of crop species as a tool for population genetics, phylogeography and phylogeny in agrobiodiversity research : [P667]

Mariac Cédric, Couderc Marie, Scarcelli Nora, Billot Claire, Barnaud Adeline, Faye Adama, Sonké Bonaventure, Pintaud Jean-Christophe, Vigouroux Yves, Couvreur Thomas. 2014. Whole chloroplast genomes of crop species as a tool for population genetics, phylogeography and phylogeny in agrobiodiversity research : [P667]. In : Plant and Animal Genomes Conference XXII Conference, San diego, United States, San Diego, United States, January 11-15, 2014. s.l. : s.n., Résumé Plant and Animal Genome Conference. 22, San Diego, États-Unis, 11 Janvier 2014/15 Janvier 2014.

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Matériel d'accompagnement : 1 poster

Résumé : Understanding the evolutionary patterns of genetic diversity of cultivated plants and their wild relatives is a fundamental aspect of agrobiodiversity research. Documenting genetic diversity and understanding the evolutionary histories of crops will have important impacts in terms of food security in southern countries such as Africa. In this study, we develop a generalized method for sequencing full chloroplast genomes via hybridization enrichment suitable for multiplexing a large number of individuals. We will present application of the method to the study of wild pearl millet, wild and cultivated yams, fonio and to African rice. (Texte intégral)

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
F70 - Taxonomie végétale et phyto-géographie

Auteurs et affiliations

  • Mariac Cédric, IRD (FRA)
  • Couderc Marie, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • Scarcelli Nora, IRD (FRA)
  • Billot Claire, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • Barnaud Adeline, IRD (FRA)
  • Faye Adama, IRD (CMR)
  • Sonké Bonaventure, Université de Yaoundé (CMR)
  • Pintaud Jean-Christophe, IRD (FRA)
  • Vigouroux Yves, IRD (FRA)
  • Couvreur Thomas, IRD (FRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/573278/)

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