Dufayard Jean-François, Paulet Florence. 2014. Synthèse d'évaluation de la formation: " Analyse bioinformatique de séquences pour l'amélioration des plantes " du 10 au 14 février 2014 à Montpellier - France. Montpellier : CIRAD, 37 p.
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Version publiée
- Français
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Résumé : La plateforme South Green dispense depuis 2011 une formation annuelle en analyse de séquences pour l'amélioration des plantes, en utilisant le système Galaxy comme plateforme pédagogique. Cette formation est ouverte à un public le plus large possible : industriels semenciers, personnels académiques, doctorants, et étudiants en agronomie. Le programme est adapté chaque année à l'état de l'art en bioinformatique, et recouvre un panorama large, allant du traitement de données brutes, à la génomique et protéomique comparative, en passant par l'annotation. Les attendus sont : i) la formation d'élèves ingénieurs agronomes et leur éveil à la bioinformatique, ii) un gain en autonomie de collègues académiques tant doctorants que permanents, iii) le renfort du lien entre nos laboratoires et le monde industriel, et iv) un échange entre ces communautés pour favoriser des collaborations, des stages ou des contrats (valorisation, bourses CIFRE...). La session 2014 s'est déroulée du 10 au 14 février. Elle a formé 12 personnes (4 étudiants, 2 privés, 6 publics). La synthèse d'évaluation met en évidence une formation très satisfaisante, remplissant pleinement ses objectifs. La prochaine session devrait prendre en considération les points d'amélioration, en particulier l'allègement du module annotation au profit du module analyse post-NGS.
Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
U10 - Informatique, mathématiques et statistiques
C10 - Enseignement
Auteurs et affiliations
- Dufayard Jean-François, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
- Paulet Florence, CIRAD-DGDRS-VALO (FRA)
Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/573460/)
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