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Whole genome expression and hydraulic architecture of diploid and doubled diploid citrus seedlings in intra and interspecific contexts

de Souza Joadson Dutra, Rodrigues Valérie, Barigah Têté Sévérien, Ollitrault Patrick, Da Silva Gesteira Abelmon, Morillon Raphaël. 2016. Whole genome expression and hydraulic architecture of diploid and doubled diploid citrus seedlings in intra and interspecific contexts. Citrus Research and Technology, 37 (2) : pp. 206-210.

Journal article ; Article de recherche ; Article de revue à comité de lecture
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Titre espagnol : Expressão genômica e arquitetura hidráulica de plântulas diplóides e duplo diplóides de Citrus intra e interspecíficos

Abstract : Genome expression in polyploid is usually considered to be quite different depending on the genetic context. While it is admitted that autotetraploids resulting from polyploidization events within species do not present major changes of genes expression, allotetraploid which result from hybridization between divergent species or lines were showed to present very important changes of expression compared to the diploid (2x) parental lines (genomic shock). In this work, we investigated the root citrus genome expression using custom Agilent Citrus microarray (4x44K format) of different couples of 2x and doubled diploid (4x) in absence of stress: Poncirus, Cleopatra Mandarin as well in the Cleopatra Mandarin × Poncirus intergeneric hybrid. We also evaluated the plant hydraulic architecture of this plant material. Our goal was to evaluate if any change in root genome expression related to polyploidy could lead to plant hydraulic architecture changes. (Résumé d'auteur)

Résumé (autre langue) : A expressão do genoma em poliploides geralmente é considerada como sendo bastante diferente, dependendo do contexto genético. Embora seja admitido que os autotetraploides resultantes de eventos de poliploidização dentro de espécies não apresentam grandes mudanças de expressão de genes, todos os alotetraploides resultantes da hibridação entre espécies divergentes ou linhas apresentaram mudanças de expressão muito importantes em comparação com as linhas parentais diploides (2x) parentais (genomic shock). Neste trabalho, investigamos a expressão do genoma de raiz de citros usando microarranjos, plataforma Agilent personalizada para Citrus (formato 4x44K) de diferentes duplas de 2x e duplos diploides (4x) na ausência de estresse: Poncirus, tangerina Cleópatra, e também hibrido intergenérico de Cleópatra × Poncirus. Também avaliamos a arquitetura hidráulica da planta. A meta foi avaliar se qualquer alteração na expressão do genoma de raiz relacionada à poliploidia poderia levar a alterações na arquitetura hidráulica da planta. (Résumé d'auteur)

Classification Agris : F30 - Plant genetics and breeding

Champ stratégique Cirad : Axe 1 (2014-2018) - Agriculture écologiquement intensive

Auteurs et affiliations

  • de Souza Joadson Dutra, UESC (BRA)
  • Rodrigues Valérie, CIRAD-BIOS-UMR ASTRE (FRA)
  • Barigah Têté Sévérien, EMBRAPA (BRA)
  • Ollitrault Patrick, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (GLP)
  • Da Silva Gesteira Abelmon, INRA (FRA)
  • Morillon Raphaël, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (GLP)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/586719/)

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