Agritrop
Home

Transferibilidade e mapeamento de microssatélites entre Theobroma cacao L. E Theobroma grandiflorum (WILLD. EX. SPRENG.) Schum

dos Santos Nascimento Anadine, Alves Rafael Moyses, de Sousa Silva Carlos Rogério, Beviláqua de Albuquerque Paulo Sérgio, Santos Lima Lemos Lívia, Peres Gramacho Karina, Clément Didier. 2019. Transferibilidade e mapeamento de microssatélites entre Theobroma cacao L. E Theobroma grandiflorum (WILLD. EX. SPRENG.) Schum. AgroTropica, 31 (2) : pp. 85-102.

Journal article ; Article de recherche ; Article de revue à comité de lecture
[img]
Preview
Published version - Portugais
Use under authorization by the author or CIRAD.
Agrotropica-cupuaçu-09-2019.pdf

Télécharger (385kB) | Preview

Type d'url non précisé : http://www.ceplac.gov.br/paginas/agrotropica/

Titre anglais : Transferability and mapping of microssatellites between Theobroma cacao L. and Theobroma grandiflorum (Willd. Ex. Spreng.) Schum

Abstract : O gênero Theobroma abrange 22 espécies nativas da região amazônica, dentre elas, duas merecem destaque de produção no Brasil: T. cacao e T. grandiflorum. Devido à importância dessas culturas e a possibilidade de obter informações através de transferibilidade de marcadores moleculares específicos de T. grandiflorum em T. cacao; ii) construir um mapa genético a partir de um cruzamento de T. grandiflorum; iii) posicionar no genoma do cacaueiro os microssatélites de T. grandiflorum. A partir de trabalhos anteriores, foram selecionados e testados 181 marcadores específicos do cacaueiro nos genitores e em cinco indivíduos da população de cupuaçuzeiro, e 44 marcadores específicos do cupuaçuzeiro em cinco genótipos de cacaueiro representativos da diversidade da espécie. As análises de transferibilidade de microssatélites entre T. cacao e T. grandiflorum mostraram uma baixa taxa de transferibilidade dos marcadores de cacaueiro quando amplificados em cupuaçuzeiro (43,09%), e uma alta taxa de transferibilidade dos marcadores de cupuaçuzeiro quando amplificados em cacaueiro (93,3%). Foi possível obter um mapeamento genético parcial de T. grandiflorum, permitindo flanquear microssatélites, das duas espécies, em sete grupos de ligação do mapa de referência do cacaueiro em um mapa genético consenso da espécie. Os resultados do presente trabalho permitiram obter mais informações sobre a transferibilidade e mapeamento de microssatélites entre T. cacao e T. grandiflorum. Tais conhecimentos possibilitam estudos posteriores sobre a diversidade genética, caracterização de germoplasma, construção de mapas genéticos e localização de QTLs.

Résumé (autre langue) : The genus Theobroma comprises 22 species native to the Amazon region, two of which deserve attention in Brazil: T. cacao and T. grandiflorum. Due to the importance of these cultures and the possibility of obtaining information through the transferability of specific molecular markers and carrying out studies in genetic mapping, this work had as objectives: i) to test the transferability of T. cacao microsatellites in T. grandiflorum, and specific of T. grandiflorum in T. cacao; ii) construct a genetic map from a cross of T. grandiflorum; iii) to position in the cacao genome the microsatellites of T. grandiflorum. From previous studies, 181 specific cacao markers were selected and tested in the parents and in five individuals of the cupuaçu tree population, and 44 cupuaçu - specific markers were evaluated in five cacao genotypes representative of the species diversity. Microsatellite transferability analyzes between T. cacao and T. grandiflorum showed a low transferability of cacao markers when amplified in cupuaçu trees (43.09%), and a high transferability of cupuaçueiro markers when amplified in cacao ( 93.3%). It was possible to obtain a partial genetic mapping of T. grandiflorum, allowing flanking microsatellites of the two species in seven linkage groups of the cacao reference map in a genetic consensus map of the species. The results of the present work allowed to obtain more information on the transferability and mapping of microsatellites between T. cacao and T.grandiflorum. Such knowledge enables further studies on genetic diversity, characterization of germplasm, genetic mapping and localization of QTLs.

Mots-clés Agrovoc : Theobroma cacao, Theobroma grandiflorum [EN], Microsatellite, Marqueur génétique, Locus des caractères quantitatifs, Carte génétique, Moniliophthora, maladie du balai de sorcière

Mots-clés géographiques Agrovoc : Brésil

Mots-clés libres : Theobroma grandiflorum, Microsatellite DNA

Classification Agris : F30 - Plant genetics and breeding

Champ stratégique Cirad : CTS 1 (2019-) - Biodiversité

Auteurs et affiliations

  • dos Santos Nascimento Anadine, UESC (BRA)
  • Alves Rafael Moyses, EMBRAPA (BRA)
  • de Sousa Silva Carlos Rogério, CEPLAC (BRA)
  • Beviláqua de Albuquerque Paulo Sérgio, CEPLAC (BRA)
  • Santos Lima Lemos Lívia, UESB (BRA)
  • Peres Gramacho Karina, CEPLAC (BRA)
  • Clément Didier, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA) ORCID: 0000-0002-7602-6472

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/593572/)

View Item (staff only) View Item (staff only)

[ Page générée et mise en cache le 2021-02-03 ]