Faecal near infrared spectroscopy (FNIRS) a support tool to manage small ruminants

Bonnal Laurent, Hassoun Philippe. 2019. Faecal near infrared spectroscopy (FNIRS) a support tool to manage small ruminants. In : Book of abstracts of the 1st Joint Meeting, FAO-CIHEAM Networks on Sheep and Goats and Mediterranean Pastures. CIHEAM, FAO. Meknès : CIHEAM-FAO, Résumé, 79. Joint meeting of the FAO-CIHEAM network on sheep and goats and mediterranean pastures: Efficiency and resilience of forage resources and small ruminant production to cope with global challenges in Mediterranean areas. 1, Meknès, Maroc, 23 Octobre 2019/25 Octobre 2019.

Titre français : La spectroscopie proche infrarouge fécale (FNIRS), un outil de pilotage pour la gestion des petits ruminants

Résumé : Faecal near infrared spectroscopy (FNIRS) can be a good technique to predict functional properties like intake or in vivo digestibility of forages by small ruminants. Data were collected from 108 different digestibility indoor and outdoor trials in Senegal and France carried out from 1993 to 2013 on sheep fed with a large variety of forage species. Faecal samples were scanned by a Foss NIRSystem 5000 monochromator. Calibrations were established on indoor trials samples and performed using the modified partial least square (mPLS) procedure to estimate dry or organic matter (DMI, OMI, g/kg metabolic weight, BW0.75) intake, in vivo dry and organic matter (DMD, OMD,%) digestibility. The derived standard errors of calibration (SEC) and coefficients of determination (R2cal) were 6.52 g/kg BW0.75 and 0.81 for DMI, 5.17 g/kg BW0.75 and 0.86 for OMI, 1.50% and 0.93 for DMD and 1.95% and 0.88 for OMD, respectively. These values confirm the interest of the use of FNIRS as a tool to manage small ruminants. The results obtained show a good accuracy with values similar to other published results for intake and digestibility. Validation on outdoor trials samples show the difficulty to extrapolate the prediction of intake with limited samples number and only one pasture quality.

Résumé (autre langue) : La spectroscopie proche infrarouge fecale (FNIRS) peut etre une bonne technique pour predire des proprietes fonctionnelles comme l'ingestion ou la digestibilite des fourrages par les petits ruminants. Les donnees proviennent de 108 essais de digestibilite differents en cage ou au paturage realises au Senegal et en France entre 1993 et 2013 sur des ovins incluant une grande variete d'especes fourrageres. Les echantillons de feces ont ete scannes avec un monochromateur Foss NIRSystem 5000. Les etalonnages ont ete effectues avec la procedure des moindres carres partiels modifiee (mPLS) avec les echantillons des essais en cages pour estimer l'ingestion de matiere seche ou de matiere organique (DMI, OMI, g/kg0,75), la digestibilite de la matiere seche ou de la matiere organique (DMD, OMD,%). Les erreurs standard d'etalonnage (SEC) et les coefficients de determination (R2cal) etaient respectivement de 6,52 g/kg0,75 et 0,81 pour DMI, 5,17 g/kg0,75 et de 0,86 pour OMI, 1,50% et 0,93 pour DMD et 1,95% et 0,88 pour OMD. Ces valeurs confirment l'interet de la FNIRS comme outil de pilotage pour la gestion des petits ruminants. Les resultats obtenus montrent une bonne precision avec des valeurs similaires a celle rencontrees dans la bibliographie. Une validation sur les echantillons des essais au paturage montre la difficulte d'extrapolation des etalonnages pour la prediction de l'ingestion lorsque le nombre d'echantillons est limite et restreint a une seule situation.

Auteurs et affiliations

• Bonnal Laurent, CIRAD-ES-UMR SELMET (FRA) ORCID: 0000-0001-5038-7432
• Hassoun Philippe, INRA (REU)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/594608/)

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