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Rapport de mission au Hatherly C2 Laboratory, University of Exeter (U.K.) du 18 au 26 février 2000

Jaligot Estelle. 2000. Rapport de mission au Hatherly C2 Laboratory, University of Exeter (U.K.) du 18 au 26 février 2000. Montpellier : CIRAD-CP, 20 p. N° de rapport : CP_SIC 1227

Mission report
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Abstract : Cette mission a été effectuée par l'auteur dans le cadre de sa thèse sur financement Projet Alliance 2000 (British Council/Egide). Cette collaboration constitue une étape fondamentale dans la mise au point de tests de détection de l'anomalie mantled basés sur des différences de méthylation à l'intérieur de séquences cibles, grâce à l'apprentissage de la technique de "bisulfite sequencing". La réaction au bisulfite repose sur la capacité du bisulfite de sodium à provoquer préférentiellement la déamination des cytosines en uracile. Une application extrêmement intéressante de cette technique est l'amplification PCR subséquente au traitement, réalisée au moyen d'amorces conçues en fonction de la conversion des cytosines de la séquence. On peut ainsi obtenir, après séquençage de l'amplicon, une réponse directe en fonction du statut de méthylation de la séquence donnée. La maîtrise complète de ctte approche, ainsi que des techniques multiples qui en dérivent, exige une connaissance étendue des phénomènes physico-chimiques mis en jeu. En effet les risques d'artefacts sont nombreux et peuvent conduire à des interprétations erronées du résultat de la réaction.

Mots-clés Agrovoc : Elaeis guineensis, Embryogénèse somatique, Variation somaclonale, Méthylation, ADN, Trouble de différenciation sexuelle, Sonde nucléique, Cytosine, Technique analytique

Mots-clés géographiques Agrovoc : Royaume-Uni

Classification Agris : F02 - Plant propagation
F30 - Plant genetics and breeding

Auteurs et affiliations

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Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/10897/)

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