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Identification et localisation de QTL associés à la plasticité phénotypique du système racinaire chez des lignées recombinantes de riz issues du croisement d'IR64 (indica) et d'Azucena (Japonica)

Rahantaharimanana Fanjavola. 2003. Identification et localisation de QTL associés à la plasticité phénotypique du système racinaire chez des lignées recombinantes de riz issues du croisement d'IR64 (indica) et d'Azucena (Japonica). Paris : INA-PG, 34 p. Mémoire DEA : Sciences agronomiques : Institut national agronomique Paris-Grignon

Disertation
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Abstract : La plasticité phénotypique, capacité d'adaptation morphophysiologique au conditions environnementale, est une composante importante de la vigueur au départ des cultures. Ce travail avait pour objet l'étude de la plasticité phénotypique du système racinaire au stade précoce du développement du riz (O. saliva) et de ses bases génétiques. Il s'inscrit dans le cadre d'un projet de recherche pluridisciplinaire cherchant à mieux comprendre le contrôle génétique et physiologique de la vigueur au départ, et à contribuer ultérieurement à l'amélioration des variétés dans ce sens. La carence en phosphore a été utilisée pour évaluer la capacité de deux lignées parentales IR64 (indica) et Azucena (japonica) et de 179 lignées recombinantes, cultivées en hydroponie, de modifier la répartition de leurs biomasses entre la partie aérienne et le système racinaire. Le dispositif expérimental comprend 2 traitements (P+ et P-) et 3 répétitions. Treize QTL sûrs, dont onze QTL impliqués dans l'expression constitutive de la morphologie du système racinaire et deux QTL inductibles liés aux effets relatifs du traitement P-, ont été mis en évidence. Ce sont surtout des QTL à effets mineurs répartis sur de nombreuses régions du génome (chromosome 1, 2, 6, 11 et 12). Ce travail a permis d'identifier des locus intéressants contrôlant la croissance et .la répartition des assimilâts. Après validation des QTL détectés, il sera possible de les utiliser dans des expériences de Sélection Assistée par Marqueurs (SAM) et d'identifier les gènes et fonctions précises associés à ces locus. Des études en génomique fonctionnelle sont en cours au CIRAD et profiteront des résultats de ce travail. (Résumé d'auteur)

Mots-clés Agrovoc : Oryza sativa, Phénotype, Système racinaire, Carence minérale, Phosphore, Locus des caractères quantitatifs, localisation de gène, Carte génétique, Génome, Descendance, Croissance, Vigueur

Mots-clés complémentaires : QTL, Lignée parentale

Classification Agris : F30 - Plant genetics and breeding
F62 - Plant physiology - Growth and development

Auteurs et affiliations

  • Rahantaharimanana Fanjavola, CIRAD-AMIS-AGRONOMIE (FRA)

Autres liens de la publication

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/527420/)

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