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Methylation-sensitive amplification polymorphism (MSAP) protocol to assess CpG and CpNpG methylation in the banana genome

Baurens Franc-Christophe, Causse Sandrine, Legavre Thierry. 2008. Methylation-sensitive amplification polymorphism (MSAP) protocol to assess CpG and CpNpG methylation in the banana genome. Fruits, 63 (2) : pp. 117-123.

Journal article ; Article de revue à facteur d'impact
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Titre français : Protocole MSAP pour évaluer les méthylations CpG et CpNpG dans le génome du bananier

Abstract : Introduction. La technique présentée fournit des marqueurs moléculaires permettant des études de la méthylation de l'ADN du génome de l'espèce Musa. Cette technique peut être utilisée pour l'étude de la méthylation de l'ADN dans les populations naturelles de bananier, dans des populations de cartographie, dans les organes de la plante et au cours du développement. Le principe, les principaux avantages, le matériel végétal utilisé, le temps nécessaire et les résultats attendus sont présentés. Matériel et méthodes. Cette partie décrit le matériel de laboratoire nécessaire, et les protocoles pour produire des autoradiographies MSAP ave HpaII / MspI (méthylation de CCGG) et EcoRII / PspGI (méthylation de CCWGG). Elle mentionne les principaux problèmes pouvant se poser. Résultats. Le protocole permet de détecter les sites CCWGG et CCGG méthylés. (Résumé d'auteur)

Mots-clés Agrovoc : Musa, Méthylation, Génome, ADN, Marqueur génétique, Technique analytique

Classification Agris : F30 - Plant genetics and breeding

Champ stratégique Cirad : Axe 1 (2005-2013) - Intensification écologique

Auteurs et affiliations

  • Baurens Franc-Christophe, CIRAD-BIOS-UMR DAP (FRA) ORCID: 0000-0002-5219-8771
  • Causse Sandrine
  • Legavre Thierry, CIRAD-BIOS-UMR DAP (FRA)

Autres liens de la publication

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/543898/)

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