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Distinguishing dung from blue, red and yellow-backed duikers through noninvasive genetic techniques

Van Vliet Nathalie, Zundel Stéphanie, Miquel Christian, Taberlet Pierre, Nasi Robert. 2008. Distinguishing dung from blue, red and yellow-backed duikers through noninvasive genetic techniques. African Journal of Ecology, 46 (3) : 411-417.

Article de revue ; Article de revue à facteur d'impact
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Résumé : Les comptages de crottes sont largement utilisés pour estimer l'abondance et la densité des céphalophes dans les forêts tropicales africaines. Cependant, une des limites importantes de cette méthode est que l'identification de l'espèce basée sur les caractéristiques morphologiques des excréments est extrêmement difficile dans la plupart des cas. Certains auteurs émettent l'hypothèse qu'il est au moins possible de distinguer entre les crottes de céphalophes bleus, du Natal et à dos jaune. Cependant, cette étude est la première tentative de tester la fiabilité de l'identification sur le terrain. Dans cette étude, nous suggérons une méthode basée sur un protocole génétique non invasif pour identifier l'espèce correspondant aux crottes. La comparaison entre identifications de terrain et génétiques montre que seules les crottes de Cephalophus silvicultor ont identifiées sans erreur sur le terrain. Le taux d'erreurs est élevé pour le céphalophe du Natal et le céphalophe bleu, et toute tentative pour faire la distinction entre ces espèces aboutirait à de fausses estimations pour les deux espèces. Nous recommandons de faire des analyses d'ADN pour s'assurer que l'identification des espèces est fiable lorsque l'on a recours aux comptages de crottes pour le recensement des céphalophes. Cet input méthodologique va probablement consolider la technique de comptage des crottes et augmenter sa fiabilité dans les estimations de l'abondance des espèces de céphalophes et dans les études de leur distribution spatiale.

Mots-clés Agrovoc : Bovidae, identification, excréments, technique analytique, adn

Mots-clés géographiques Agrovoc : Gabon

Mots-clés complémentaires : Cephalophus

Classification Agris : L20 - Écologie animale
U30 - Méthodes de recherche

Champ stratégique Cirad : Hors axes (2005-2013)

Auteurs et affiliations

  • Van Vliet Nathalie, CIRAD-ES-UPR Ressources forestières (FRA)
  • Zundel Stéphanie, CNRS (FRA)
  • Miquel Christian, CNRS (FRA)
  • Taberlet Pierre, CNRS (FRA)
  • Nasi Robert, CIRAD-ES-UPR Ressources forestières (FRA)

Autres liens de la publication

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/545810/)

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