Caractérisation moléculaire des ITS des champignons dégradant les bois de Guyane

Suong Malyna. 2011. Caractérisation moléculaire des ITS des champignons dégradant les bois de Guyane. Montpellier : UM2, 47 p. Mémoire de master : Biodiversité végétale tropicale : Université Montpellier 2

Résumé : Actuellement les champignons des régions tropicales sont sous-représentés dans la classification contrairement à ceux des zones européennes où la diversité et la taxonomie fongique est bien mieux connue. Cette étude est essentiellement destinée à préciser et fiabiliser l'identification moléculaire des champignons tropicaux, notamment ceux qui dégradent les bois. Elle a été réalisée à partir de 80 carpophores secs et 27 mycéliums purs des souches de champignons lignivores de Guyane. Cette étude taxonomique basée sur les séquences de la région ITS entre l'ITS1 et l'ITS2 a montré que parmi les 107 champignons étudiés, 42 ont pu être identifiées par BLAST. La plupart sont des ascomycètes des genres tels que Alternaria, Aspergillus, Dipodascus, Galactomyces, Helicomyces et Xylaria. BLAST a également identifié les principaux genres de basidiomycètes dégradant les bois tels que Auricularia, Coriolopsis, Fomitopsis, Geastrum, Gloeophyllum, Ganoderma, Lentinus, Phlebia, Pycnoporus, Stereum, Steccherinum et Trametes. Ainsi, cette étude devra permettre une meilleure connaissance de la diversité des champignons lignivores issus d'écosystèmes forestiers de Guyane. Elle servira également de base pour des études concernant la détection précoce de champignons dans les bois et la traçabilité des bois tropicaux.

Mots-clés Agrovoc : Champignon, taxonomie, bois, biologie moléculaire, biodégradation

Mots-clés géographiques Agrovoc : Guyane française, France

Classification Agris : F70 - Taxonomie végétale et phytogéographie
F30 - Génétique et amélioration des plantes
H01 - Protection des végétaux - Considérations générales

Auteurs et affiliations

• Suong Malyna, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/562416/)

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