Agritrop
Home

Reconstructing plant architecture from 3D laser scanner data

Preuksakarn Chakkrit. 2012. Reconstructing plant architecture from 3D laser scanner data. Montpellier : UM2, 134 p. Thesis Ph. D. : Science in Computer Science : Université Montpellier 2

Thesis
[img]
Preview
Published version - Anglais
Use under authorization by the author or CIRAD.
document_567499.pdf

Télécharger (21MB) | Preview

Encadrement : Godin, Christophe ; Boudon, Frédéric

Abstract : En infographie, les modèles virtuels de plantes sont de plus en plus réalistes visuellement. Cependant, dans le contexte de la biologie et l'agronomie, l'acquisition de modèles précis de plantes réelles reste un problème majeur pour la construction de modèles quantitatifs du développement des plantes. Récemment, des scanners laser 3D permettent d'acquérir des images 3D avec pour chaque pixel une profondeur correspondant à la distance entre le scanner et la surface de l'objet visé. Cependant, une plante est généralement un ensemble important de petites surfaces sur lesquelles les méthodes classiques de reconstruction échouent. Dans cette thèse, nous présentons une méthode pour reconstruire des modèles virtuels de plantes à partir de scans laser. Mesurer des plantes avec un scanner laser produit des données avec différents niveaux de précision. Les scans sont généralement denses sur la surface des branches principales mais recouvrent avec peu de points les branches fines. Le cur de notre méthode est de créer itérativement un squelette de la structure de la plante en fonction de la densité locale de points. Pour cela, une méthode localement adaptative a été développée qui combine une phase de contraction et un algorithme de suivi de points. Nous présentons également une procédure d'évaluation quantitative pour comparer nos reconstructions avec des structures reconstruites par des experts de plantes réelles. Pour cela, nous explorons d'abord l'utilisation d'une distance d'édition entre arborescence. Finalement, nous formalisons la comparaison sous forme d'un problème d'assignation pour trouver le meilleur appariement entre deux structures et quantifier leurs différences. (Résumé d'auteur)

Mots-clés Agrovoc : Morphologie végétale, Bioinformatique, Port de la plante, Anatomie végétale

Mots-clés complémentaires : Architecture végétale

Classification Agris : U10 - Computer science, mathematics and statistics
F50 - Plant structure
U30 - Research methods

Champ stratégique Cirad : Hors axes (2005-2013)

Auteurs et affiliations

  • Preuksakarn Chakkrit, CIRAD-BIOS-UMR DAP (FRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/567499/)

View Item (staff only) View Item (staff only)

[ Page générée et mise en cache le 2021-01-08 ]