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Les logiciels pour la sélection génomique

Denis Marie. 2016. Les logiciels pour la sélection génomique. In : Sélection génomique : théorie et mise en oeuvre en relation avec les programmes d'amélioration. Deretz Séverine (ed.). INRA, CIRAD. Paris : INRA, 145-154. (Ecoles-chercheurs INRA, 6) ISBN 2-7380-1387-2 Ecoles-chercheurs INRA sur la sélection géonomique 2013 - Théorie et mise en oeuvre en relation avec les programmes d'amélioration, Bruz, 23 Septembre 2013/27 Septembre 2013.

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Résumé : Cette section donne un aperçu des logiciels permettant la mise en oeuvre des méthodes utilisées pour la sélection génomique. Plusieurs packages du logiciel R sont étudiés au travers d'un jeu de données commun sur le maïs. Pour chaque package, un descriptif des méthodes implémentées ainsi qu 'un script R sont donnés.

Résumé (autre langue) : This section presents an overview of software tools used in genomic selection. Severa! R packages are studied through a cornmon data set on maize. For each package, a description of implemented methods, as well a R script are provided.

Classification Agris : U10 - Informatique, mathématiques et statistiques
F30 - Génétique et amélioration des plantes

Auteurs et affiliations

  • Denis Marie, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)

Autres liens de la publication

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/582578/)

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