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Multiscale functional-structural plant modelling at the example of apple trees: Project description

Bayol Benoît, Cournède Paul-Henry, Sainte-Marie Julien, Viaud Gautier, Chi Faustino, Kurth Winfried, Long Qinqin, Merklein Johannes, Streit Katarína, Costes Evelyne, Migault Vincent, Pallas Benoît, Buck-Sorlin Gerhard H., Poirier Magalie, Pradal Christophe. 2016. Multiscale functional-structural plant modelling at the example of apple trees: Project description. In : 2016 IEEE International Conference on Functional-Structural Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (FSPMA). IEEE, FSPMA. Qingdao : IEEE, 1-5. ISBN 978-1-5090-1659-4 IEEE International Conference on Functional-Structural Plant Growth Modeling, Simulation, Visualization and Applications (FSPMA 2016), Qingdao, Chine, 7 Novembre 2016/11 Novembre 2016.

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Résumé : We describe an ongoing project which aims at a better understanding of the development and functioning of apple trees by modelling them at several spatial and temporal scales. Dependence of growth and carbon allocation upon genotype, environmental variables (particularly, water supply), fruit load and experimental manipulation of carbon transport is investigated and simulated. For the required functional-structural models, new tools are developed, especially for handling multiple-scale representations of the same organism in a user-friendly way, for cross-platform modelling and for facilitating the application of rigorous methods of parameter estimation and sensitivity analysis.

Mots-clés libres : GroIMP, Multiscale model, Tree development, Genotype-phenotype interactions, Drought stress effects, Carbon partitioning, Upscaling, Parameter estimation, Sensitivity analysis, Cross-platform modelling, Data interface, Mapplet, Openalea

Classification Agris : U10 - Informatique, mathématiques et statistiques
F30 - Génétique et amélioration des plantes
F62 - Physiologie végétale - Croissance et développement
F50 - Anatomie et morphologie des plantes
H50 - Troubles divers des plantes

Auteurs et affiliations

  • Bayol Benoît, Université Paris-Saclay (FRA)
  • Cournède Paul-Henry, Université Paris-Saclay (FRA)
  • Sainte-Marie Julien, Université Paris-Saclay (FRA)
  • Viaud Gautier, Université Paris-Saclay (FRA)
  • Chi Faustino, Georg-August University of Göttingen (DEU)
  • Kurth Winfried, Georg-August University of Göttingen (DEU)
  • Long Qinqin, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
  • Merklein Johannes, Georg-August University of Göttingen (DEU)
  • Streit Katarína, Georg-August University of Göttingen (DEU)
  • Costes Evelyne, INRA (FRA)
  • Migault Vincent, INRA (FRA)
  • Pallas Benoît, INRA (FRA)
  • Buck-Sorlin Gerhard H., Agrocampus Ouest (FRA)
  • Poirier Magalie, INRA (FRA)
  • Pradal Christophe, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA) ORCID: 0000-0002-2555-761X

Autres liens de la publication

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/583257/)

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