Gallet Romain, Kraberger Simona, Filloux Denis, Galzi Serge, Fontes Hugo, Martin Darren Patrick, Varsani Arvind, Roumagnac Philippe. 2018. Nanovirus‐alphasatellite complex identi ed in Vicia cracca in the Rhône delta region of France. Archives of Virology, 163 (3) : 695-700.
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Quartile : Q3, Sujet : VIROLOGY
Résumé : Nanoviruses are multi-component plant-infecting single-stranded DNA viruses. Using a viral metagenomics-informed approach, a new nanovirus and two associated alphasatellite molecules have been identified in an uncultivated asymptomatic Vicia cracca plant in the Rhône region of France. This novel nanovirus genome includes eight genomic components (named DNA-R, DNA-S, DNA-M, DNA-C, DNA-N, DNA-U1, DNA-U2 and DNA-U4) and, across all components, shares < 66% pairwise sequence identity with other nanovirus genomes. The two associated alphasatellites share 62% identity with each other and < 81% identity will all other nanovirus-associated alphasatellites.
Mots-clés Agrovoc : virus des végétaux, Vicia cracca, génomique, adn, génome, identification, virologie
Mots-clés géographiques Agrovoc : France
Mots-clés complémentaires : Nanoviridae
Classification Agris : H20 - Maladies des plantes
Champ stratégique Cirad : Axe 4 (2014-2018) - Santé des animaux et des plantes
Agences de financement européennes : European Commission
Programme de financement européen : FP7
Projets sur financement : (EU) A second metagenomics generation to better understand plant virus ecology and evolution
Auteurs et affiliations
- Gallet Romain, INRA (FRA)
- Kraberger Simona, Arizona State University (USA)
- Filloux Denis, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (FRA)
- Galzi Serge, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (FRA)
- Fontes Hugo, La Tour du Valat, Centre de recherche pour la conservation des zones humides méditerranéennes (FRA)
- Martin Darren Patrick, UCT (ZAF)
- Varsani Arvind, Arizona State University (USA)
-
Roumagnac Philippe, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (FRA)
ORCID: 0000-0001-5002-6039 - auteur correspondant
Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/587369/)
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