Agritrop
Accueil

The Guiana cacao genetic group (Theobroma cacao L.): A new core collection in French Guiana

Lachenaud Philippe, Clément Didier, Argout Xavier, Scalabrin Simone, Doare Fabien. 2018. The Guiana cacao genetic group (Theobroma cacao L.): A new core collection in French Guiana. Botany Letters, 165 (2) : 248-254.

Article de revue ; Article de recherche ; Article de revue à facteur d'impact
[img] Version Online first - Anglais
Accès réservé aux personnels Cirad
Utilisation soumise à autorisation de l'auteur ou du Cirad.
The Guiana cacao genetic group Theobroma cacao L a new core collection in French Guiana.pdf

Télécharger (977kB) | Demander une copie
[img] Version publiée - Anglais
Accès réservé aux personnels Cirad
Utilisation soumise à autorisation de l'auteur ou du Cirad.
The Guiana cacao genetic group Theobroma cacao L a new core collection in French Guiana.pdf

Télécharger (798kB) | Demander une copie

Quartile : Q4, Sujet : PLANT SCIENCES

Résumé : Since 1985, CIRAD has been involved in surveying, collecting, studying and conserving ex situ wild cacao trees of French Guiana. Around 225 accessions of this genetic material (open progenies and clones), derived from 18 demes (sub-populations), are currently conserved in a collection at the Perennial Plants Biological Resource Centre (CRB-PPG) in French Guiana, at CIRAD's Paracou-Combi station, in Sinnamary. In 2004, an initial “core collection” of clones was founded on a virtually exhaustive representation of the different demes collected, with some phenotypically well-described clones. Following the genotyping of 181 of those clones by GBS (Genotyping by Sequencing), the availability of a large number of SNP markers (Single Nucleotide Polymorphism) enabled us to modernize the “core collection”. Thus, of the 181 wild cacao trees clones, genotyped by 1953 SNPs (without missing data), a new core collection was obtained using COREFINDER software, comprising 41 clones representing 100% of the variability encountered.

Mots-clés Agrovoc : Theobroma cacao, conservation des ressources génétiques, collection de matériel génétique, marqueur génétique, génotype, clone, plante sauvage, génétique des populations

Mots-clés géographiques Agrovoc : Guyane française, France

Mots-clés libres : Cocoa, Collection, Core collection, COREFINDER, Guyane, Paracou-Combi, Theobroma cacao

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes

Champ stratégique Cirad : Axe 1 (2014-2018) - Agriculture écologiquement intensive

Agences de financement européennes : European Regional Development Fund

Projets sur financement : (EU) Diversity of wild cocoa trees in French Guiana, and associated endophytes

Auteurs et affiliations

  • Lachenaud Philippe, CIRAD-BIOS-UPR Bioagresseurs (FRA) - auteur correspondant
  • Clément Didier, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (BRA) ORCID: 0000-0002-7602-6472
  • Argout Xavier, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (COL) ORCID: 0000-0002-0100-5511
  • Scalabrin Simone, IGA Technology (ITA)
  • Doare Fabien, CIRAD-BIOS-UPR Bioagresseurs (GUF)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/587807/)

Voir la notice (accès réservé à Agritrop) Voir la notice (accès réservé à Agritrop)

[ Page générée et mise en cache le 2024-03-28 ]