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2018

Next generation sequencing elucidates cacao badnavirus diversity and reveals the existence of more than ten viral species. Muller Emmanuelle, Ravel Sébastien, Agret Clément, Abrokwah Francis, Dzahini-Obiatey Henry, Galyuon I., Kouakou K., Jeyaseelan E.C., Allainguillaume Joel, Wetten Andrew. 2018. Virus Research, 244 : pp. 235-251.
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2016

Biological control of cacao diseases. Ten Hoopen Gerben Martijn, Krauss Ulrike. 2016. In : Cacao diseases: a history of old enemies and new encounters. Bailey Bryan A. (ed.), Meinhardt Lyndel W. (ed.). Cham : Springer International Publishing, pp. 511-566. ISBN 978-3-319-24787-8
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Cacao Swollen Shoot Virus (CSSV): History, Biology, and Genome. Muller Emmanuelle. 2016. In : Cacao diseases. A history of old enemies and new encounters. Bryan A. Bailey (ed.), Lyndel W. Meinhardt (ed.). Cham : Springer International Publishing, pp. 337-358. ISBN 978-3-319-24787-8
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Geographical distribution of Cacao swollen shoot virus molecular variability in Ghana. Abrokwah Francis, Dzahini-Obiatey Henry, Galyuon Isaac, Osae-Awuku Francis, Muller Emmanuelle. 2016. Plant Disease, 100 (10) : pp. 2011-2017.
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Tropical crop pests and diseases in a climate change setting - A few examples. Cilas Christian, Goebel François-Régis, Babin Régis, Avelino Jacques. 2016. In : Climate change and agriculture worldwide. Torquebiau Emmanuel (ed.), Manley David (trad.), Cowan Paul (trad.). Heidelberg : Springer, pp. 73-82. ISBN 978-94-017-7460-4
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2014

Diversité moléculaire du CSSV (Cocoa swollen shoot virus) et épidémiologie de la maladie du swollen shoot du cacaoyer (Theobroma cacao L.) en Côte d'Ivoire. Kouakou Koffie. 2014. Abidjan : Université Félix Houphouët Boigny, 141 p. Thèse de doctorat : Phytovirologie : Université Félix Houphouët Boigny
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2012

Geographical differentiation of the molecular diversity of cacao swollen shoot virus in Togo. Oro Zokou Franck, Mississo Essivi, Okassa Mireille, Guilhaumon Claire, Fenouillet Catherine, Cilas Christian, Muller Emmanuelle. 2012. Archives of Virology, 157 (3) : pp. 509-514.
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Geographical distribution of Cacao swollen shoot virus Molecular Variability in Côte d'Ivoire. Kouakou Koffie, Kébé Boubacar Ismaël, Kouassi N., Ake Séverin, Cilas Christian, Muller Emmanuelle. 2012. Plant Disease, 96 (10) : pp. 1445-1450.
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Spatiotemporal pattern analysis of Cacao swollen shoot virus in experimental plots in Togo. Oro Zokou Franck, Bonnot François, Ngo Bieng Marie-Ange, Delaitre Eric, Dufour Bernard Pierre, Ametefe Komivi Exonam, Mississo Essivi, Wegbe Komlan, Muller Emmanuelle, Cilas Christian. 2012. Plant Pathology, 61 (6) : pp. 1043-1051.
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2011

Analyse des dynamiques spatiales et épidémiologie moléculaire de la maladie du swollen shoot du cacaoyer au Togo. Oro Zokou Franck. 2011. s.l. : UM2, 258 p. Thèse de doctorat : Systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences hydrosciences et environnement . Epidémiologie végétale des maladies transmises par vecteur : Université Montpellier 2
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Compréhension de l'origine des nouveaux foyers de Cacao swollen shoot virus (cssv) au Togo et en Côte d'Ivoire. Muller Emmanuelle, Kouakou Koffie, Kébé Ismael S., Mississo Angèle, Oro Zokou Franck, Fenouillet Catherine, Cilas Christian. 2011. In : 13èmes Rencontres de virologie végétale (RVV 2011), Aussois, France, 16-20 janvier 2011. SFP. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. Rencontres de virologie végétale. 13, Aussois, France, 16 January 2011/20 January 2011.
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Impact de la maladie virale du swollen shoot du cacaoyer sur la production de cacao en milieu paysan à Bazré (Côte d'Ivoire). Kouakou Koffie, Kébé Boubacar Ismaël, Kouassi N., Anno A.P., Aké S., Muller Emmanuelle. 2011. Journal of Applied Biosciences, 43 : pp. 2947-2957.
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2010

Dynamics of cocoa swollen shoot disease in Togo from satellite images and field observations at regional and local levels. Oro Zokou Franck, Delaitre Eric, Wegbe Komlan, Mississo Essivi, Muller Emmanuelle, Dufour Bernard Pierre, Cilas Christian. 2010. In : Proceedings of Agro 2010 : the XIth ESA Congress, August 29th - September 3rd, 2010, Montpellier, France. Wery Jacques (ed.), Shili-Touzi I. (ed.), Perrin A. (ed.). Montpellier : Agropolis international, pp. 151-152. ISBN 978-2-909613-01-7 ESA Congress. 11, Montpellier, France, 29 August 2010/3 September 2010.
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Variabilité moléculaire du virus du swollen shoot du cacaoyer (CSSV) en lien avec de nouveaux foyers au Togo et en Côte d'Ivoire ; validation d'un diagnostic polyvalent du virus : validation d'un diagnostic polyvalent du virus. Muller Emmanuelle, Kouakou Koffie, Kébé Ismael S., Mississo Angèle, Oro Zokou Franck, Cilas Christian. 2010. In : 16th International Cocoa Research Conference. Proceedings : towards rational cocoa production and efficient use ofr a sustainable world cocoa economy = 16e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère.Actes ; 16 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Actas ; 16 Conferencia Internacional de investigacion en cacao. Actas : vers une économie cacaoyère durable : quelles stratégies d'approche ? ; para uma produção racional de cacau e o seu uso eficiente para uma economia mundial sustentada do cacau ; hacia una produccion racional y un uso eficiente del cacao para la sustentabilitd. Lagos : Cocoa Producers' Alliance, Résumé, pp. 707-710. ISBN 978-065-959-5 Conférence Internationale sur la Recherche Cacaoyère. 16, Bali, Indonésie, 16 November 2009/21 November 2009.
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2008

Cacao swollen shoot virus. Muller Emmanuelle. 2008. In : Characterization, diagnosis and management of plant viruses. Industrial crops. Rao Govind P. (ed.), Paul Khurana S.M. (ed.), Lenardon Sergio L. (ed.). Houston : Studium Press LLC, pp. 423-444. (Plant pathogens series, 1) ISBN 1-933699-31-0
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Cacao swollen shoot virus. Muller Emmanuelle. 2008. In : Encyclopedia of virology. Mahy B.W.J. (ed.), Van Regenmortel M.H.V. (ed.). Londres : Academic Press, pp. 403-409. ISBN 978-0-12-373935-3

2005

Occurrence of cacao swollen shoot virus in Litimé, the main cocoa-producing area of Togo. Cilas Christian, Muller Emmanuelle, Mississo Essivi. 2005. Plant Disease, 89 (8) : p. 913.

2004

Cacao swollen shoot virus référence CAC-v1. Muller Emmanuelle. 2004. In : Analyses de risque phytosanitaire : appui à la rédaction de la réglementation spécifique aux départements d'outre-mer. Mourichon Xavier, Camou Romain, Ehret Pierre. CIRAD, CEE-POSEIDOM, France-Ministère de l'agriculture et de la pêche. Montpellier : CIRAD, 4 p.

2003

Four new full sequences of cacao swollen shoot virus: A PCR full length cloning strategy and a variability analysis. Muller Emmanuelle, Sackey Sammy. 2003. In : Advances in plant virology : A three day International conference at CIRAD, Montpellier, France on 29 September - 1 October 2003. AAB, CIRAD-AMIS, INRA, ENSAM, IRD. Warwick : AAB, Résumé, 1 p. International Conference : Advances in Plant Virology, Montpellier, France, 29 September 2003/1 October 2003.

Variabilité du virus du Swollen shoot (CSSV): clonage et analyse de quatre nouvelles séquences entières. Muller Emmanuelle, Sackey Sammy. 2003. In : 9ème Rencontres de virologie végétale, 2 au 6 février 2006, Aussois. Pierre Yot ; CNRS. Strasbourg : CNRS, Résumé, p. 17. Rencontres de virologie végétale. 9, Aussois, France, 2 February 2003/6 February 2003.

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