Résultats pour Auteur : "Barbe, Valérie"

Chromosome-scale assemblies of plant genomes using nanopore long reads and optical maps. Belser Caroline, Istace Benjamin, Denis Erwan, Dubarry Marion, Baurens Franc-Christophe, Falentin Cyril, Genete Mathieu, Berrabah Wahiba, Chèvre Anne-Marie, Delourme Régine, Deniot Gwenaëlle, Denoeud France, Duffé Philippe, Engelen Stefan, Lemainque Arnaud, Manzanares-Dauleux Maria J., Martin Guillaume, Morice Jérôme, Noël Benjamin, Vekemans Xavier, D'Hont Angélique, Rousseau-Gueutin Mathieu, Barbe Valérie, Cruaud Corinne, Wincker Patrick, Aury Jean-Marc. 2018. Nature Plants, 4 (11) : 879-887.

Horizontal gene transfer plays a major role in the pathological convergence of Xanthomonas lineages on common bean. Chen Nicolas W.G., Serres-Giardi Laurana, Ruh Mylène, Briand Martial, Bonneau Sophie, Darrasse Armelle, Barbe Valérie, Gagnevin Lionel, Koebnik Ralf, Jacques Marie Agnès. 2018. BMC Genomics, 19:606, 20 p.

Comparative genomics of 43 strains of Xanthomonas citri pv. citri reveals the evolutionary events giving rise to pathotypes with different host ranges. Gordon Jonathan, Lefeuvre Pierre, Escalon Aline, Barbe Valérie, Cruveiller Stéphane, Gagnevin Lionel, Pruvost Olivier. 2015. BMC Genomics, 16 (1098), 20 p.

Draft genome sequence of Xanthomonas sacchari strain LMG 476. Pieretti Isabelle, Bolot Stéphanie, Carrère Sébastien, Barbe Valérie, Cociancich Stéphane, Rott Philippe, Royer Monique. 2015. Genome Announcements, 3 (2):e00146, 2 p.

Genome mining reveals the genus Xanthomonas to be a promising reservoir for new bioactive non-ribosomally synthesized peptides. Royer Monique, Koebnik Ralf, Marguerettaz Mélanie, Barbe Valérie, Robin Guillaume P., Brin Christelle, Carrère Sébastien, Gomez Camila, Hügelland Manuela, Völler Ginka H., Noëll Julie, Pieretti Isabelle, Rausch Saskia, Verdier Valérie, Poussier Stéphane, Rott Philippe, Süssmuth Roderich, Cociancich Stéphane. 2013. BMC Genomics, 14 (658), 19 p.

Genome sequence of Xanthomonas fuscans subsp. fuscans strain 4834-R reveals that flagellar motility is not a general feature of xanthomonads. Darrasse Armelle, Carrère Sébastien, Barbe Valérie, Boureau Tristan, Arrieta-Ortiz Mario L., Bonneau Sophie, Briand Martial, Brin Christelle, Cociancich Stéphane, Durand Karine, Fouteau Stéphanie, Gagnevin Lionel, Guérin Fabien, Guy Endrick, Indiana Arnaud, Koebnik Ralf, Lauber Emmanuelle, Munoz Alejandra, Noel Laurent D., Pieretti Isabelle, Poussier Stéphane, Pruvost Olivier, Robène-Soustrade Isabelle, Rott Philippe, Royer Monique, Serres-Giardi Laurana, Szurek Boris, Van Sluys Marie-Anne, Verdier Valérie, Vernière Christian, Arlat Mathieu, Manceau Charles, Jacques Marie Agnès. 2013. BMC Genomics, 14 (761), 30 p.

Three infectious viral species lying in wait in the banana genome. Chabannes Matthieu, Baurens Franc-Christophe, Duroy Pierre-Olivier, Bocs Stéphanie, Vernerey Marie-Stéphanie, Rodier-Goud Marguerite, Barbe Valérie, Gayral Philippe, Iskra Caruana Marie-Line. 2013. Journal of Virology, 87 (15) : 8624-8637.

Evolutionary history of contagious bovine pleuropneumonia using next generation sequencing of mycoplasma mycoides subsp. mycoides "small colony". Dupuy Virginie, Manso-Silvan Lucia, Barbe Valérie, Thebault Patricia, Dordet-Frisoni Emilie, Citti Christine, Poumarat François, Blanchard Alain, Breton Marc, Sirand-Pugnet Pascal, Thiaucourt François. 2012. PloS One, 7 (10):e46821, 13 p.

Genomic insights into strategies used by Xanthomonas albilineans with its reduced artillery to spread within sugarcane xylem vessels. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Valérie, Arlat Mathieu, Gabriel Dean W., Rott Philippe, Cociancich Stéphane. 2012. BMC Genomics, 13 (658), 23 p.

Mycoplasma mycoides, from "mycoides Small Colony" to "capri". A microevolutionary perspective. Thiaucourt François, Manso-Silvan Lucia, Salah Woubit, Barbe Valérie, Vacherie Benoit, Jacob Daniel, Breton Marc, Dupuy Virginie, Lomenech Anne Marie, Blanchard Alain, Sirand-Pugnet Pascal. 2011. BMC Genomics, 12 (114), 19 p.

Genomes of three tomato pathogens within the Ralstonia solanacearum species complex reveal significant evolutionary divergence. Remenant Benoit, Coupat-Goutaland Bénédicte, Guidot Alice, Cellier Gilles, Wicker Emmanuel, Allen Caitilyn, Fegan Mark, Pruvost Olivier, Elbaz Mounira, Calteau Alexandra, Salvignol Georges, Mornico Damien, Mangenot Sophie, Barbe Valérie, Medigue Claudine, Prior Philippe. 2010. BMC Genomics, 11 (379) : 1-16.

Alliance of proteomics and genomics to unravel the specificities of Sahara bacterium Deinococcus deserti. De Groot Arjan, Dulermo Rémi, Ortet Philippe, Blanchard Laurence, Guérin Philippe, Fernandez Bernard, Vacherie Benoit, Dossat Carole, Jolivet Edmond, Siguier Patricia, Chandler Michael, Barakat Mohamed, Dedieu Alain, Barbe Valérie, Heulin Thierry, Sommer Suzanne, Achouak Wafa, Armengaud Jean. 2009. PLoS Genetics, 5 (3):e1000434, 12 p.

The complete genome sequence of Xanthomonas albilineans provides new insights into the reductive genome evolution of the xylem-limited Xanthomonadaceae. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Véronique, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2009. BMC Genomics, 10 (616), 15 p.

Legumes symbioses : Absence of Nod genes in photosynthetic bradyrhizobia. Giraud Eric, Moulin Lionel, Vallenet David, Barbe Valérie, Cytryn Eddie, Avarre Jean-Christophe, Jaubert Marianne, Simon Damien, Cartieaux Fabienne, Prin Yves, Béna Gilles, Hannibal Laure, Fardoux Joël, Kojadinovic Mila, Vuillet Laurie, Lajus Aurélie, Cruveiller Stéphane, Rouy Zoe, Mangenot Sophie, Segurens Béatrice, Dossat Carole, Franck William L., Chang Woo-Suk, Saunders Elizabeth, Bruce David, Richardson Paul, Normand Philippe, Dreyfus Bernard, Pignol David, Stacey Gary, Emerich David, Vermeglio André, Medigue Claudine, Sadowsky Michael. 2007. Science, 316 (5829) : 1307-1312.

Genome mining reveals a novel and promising NRPS gene cluster in Xanthomonas albilineans, Xanthomonas oryzae and Xanthomonas translucens. Royer Monique, Koebnik Ralf, Marguerettaz Mélanie, Barbe Valérie, Robin Guillaume P., Brin Christelle, Carrère Sébastien, Gomez Camila, Hügelland Manuela, Völler Ginka H., Noëll Julie, Pieretti Isabelle, Rausch Saskia, Verdier Valérie, Poussier Stéphane, Rott Philippe, Süssmuth Roderich, Cociancich Stéphane. 2013. In : Resumos do 59° Congresso Brasileiro de Genética,16 a 19 de Setembro de 2013, Águas de Lindóia, Brasil. SBG. s.l. : s.n., Résumé, 30. ISBN 978-85-89109-06-2 Congresso Brasileiro de Genética. 59, Aguas de Lindoia, Brésil, 16 Septembre 2013/19 Septembre 2013.

The three infectious Banana streak virus species present in the banana genome of Pisang Klutuk Wulung (PKW) are allelic. Chabannes Matthieu, Baurens Franc-Christophe, Duroy Pierre-Olivier, Bocs Stéphanie, Vernerey Marie-Stéphanie, Rodier-Goud Marguerite, Barbe Valérie, Gayral Philippe, Iskra Caruana Marie-Line. 2013. In : Polyploïde et cytogénétique, Rennes, France, 16-17 mai 2013. s.l. : s.n., 1 p. Polyploïdie et cytogénétique, Rennes, France, 16 Mai 2013/17 Mai 2013.

The complete genome sequence of Xanthomonas albilineans provides new insights into the reductive genome evolution of the xylem-limited Xanthomonadaceae. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Szurek Boris, Verdier Véronique, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2009. In : Abstracts of the XIV International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions, July 19-23, 2009, Quebec City, Canada. IS-MPMI. Saint-Paul : IS-MPMI, Résumé, 1 p. International Congress on Molecular Plant-Microbe Interactions. 14, Québec, Canada, 19 Juillet 2009/23 Juillet 2009.

Genome mining indicates that the genus Xanthomonas is a promising reservoir for new bioactive non-ribosomally synthesized peptides. Royer Monique, Koebnik Ralf, Marguerettaz Mélanie, Barbe Valérie, Robin Guillaume P., Brin Christelle, Carrère Sébastien, Gomez Camila, Hügelland Manuela, Völler Ginka H., Noëll Julie, Pieretti Isabelle, Rausch Saskia, Verdier Valérie, Poussier Stéphane, Rott Philippe, Süssmuth Roderich, Cociancich Stéphane. 2012. In : COST Action CM0804 Chemistry and Target Identification of Natural Products Workshop, Bucharest, Romania, 22-24 May 2012. s.l. : s.n., 42-43. COST Action CM0804 Chemistry and Target Identification of Natural Products Workshop, Bucarest, Roumanie, 22 Mai 2012/24 Mai 2012.

Genome mining indicates that the genus Xanthomonas is a promising reservoir for new bioactive non-ribosomally synthesized peptides. Royer Monique, Koebnik Ralf, Marguerettaz Mélanie, Barbe Valérie, Robin G., Brind C., Carrère Sébastien, Gomez Camila, Hügelland Manuela, Völler Ginka H., Noëll Julie, Pieretti Isabelle, Rausch Saskia, Verdier Valérie, Poussier Stéphane, Rott Philippe, Süssmuth Roderich, Cociancich Stéphane. 2012. In : 8e colloque de la Société Française de Phytopathologie, 5 au 8 juin 2012,Paris, France : Livre des résumés. Attard Agnès (ed.), Barny Marie-Anne (ed.), Brisset Marie-Noelle (ed.), Cilas Christian (ed.), Dellagi Alia (ed.), Desprez-Loustau Marie-Laure (ed.), Expert Dominique (ed.), Fabre Frédéric (ed.), Fagard Mathilde (ed.), Fudal Isabelle (ed.), Genin Stéphane. SFP, INRA, CNRS. Paris : SFP, Résumé, 44. Congrès de la Société française de phytopathologie. 8, Paris, France, 5 Juin 2012/8 Juin 2012.

Genome mining indicates that the genus Xanthomonas is a promising reservoir for new bioactive non-ribosomally synthesized peptides. Royer Monique, Koebnik Ralf, Marguerettaz Mélanie, Barbe Valérie, Robin P. Guillaume, Brin Christelle, Carrère Sébastien, Gomez Camila, Hügelland Manuela, Völler Ginka H., Noëll Julie, Pieretti Isabelle, Rausch Saskia, Verdier Valérie, Poussier Stéphane, Rott Philippe, Süssmuth Roderich, Cociancich Stéphane. 2012. In : 4th Xanthomonas genomics conference, Angers, France, july 9-12, 2012 : Book of abstracts. Manceau Charles (ed.), Jacques Marie Agnès (ed.), Arlat Mathieu (ed.), Lauber Emmanuelle (ed.), Noel Laurent D. (ed.), Gagnevin Lionel (ed.), Pruvost Olivier (ed.), Rott Philippe (ed.), Royer Monique (ed.), Koebnik Ralf (ed.), Verdier Valérie (ed.). INRA, INRA-LIPM, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT, IRD. Paris : INRA, Résumé, 20. Xanthomonas genomics conference 2012. 4, Angers, France, 9 Juillet 2012/12 Juillet 2012.

Genome sequencing of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli CFBP4834-R reveals that flagellar motility is not a general feature of xanthomonads. Darrasse Armelle, Carrère Sébastien, Barbe Valérie, Bourreau Tristan, Bernal Adriana Jimena, Bonneau Sophie, Brin Christelle, Cociancich Stéphane, Durand Karine, Fouteau Stéphanie, Gagnevin Lionel, Gouzy Jérôme, Guérin Fabien, Guy Endrick, Indiana Arnaud, Koebnik Ralf, Lauber Emmanuelle, Munoz Alejandra, Noel Laurent D., Pieretti Isabelle, Poussier Stéphane, Pruvost Olivier, Robène-Soustrade Isabelle, Rott Philippe, Royer Monique, Szurek Boris, Van Sluys Marie-Anne, Verdier Valérie, Vernière Christian, Arlat Mathieu, Manceau Charles, Jacques Marie Agnès. 2012. In : 4th Xanthomonas genomics conference, Angers, France, july 9-12, 2012 : Book of abstracts. Manceau Charles (ed.), Jacques Marie Agnès (ed.), Arlat Mathieu (ed.), Lauber Emmanuelle (ed.), Noel Laurent D. (ed.), Gagnevin Lionel (ed.), Pruvost Olivier (ed.), Rott Philippe (ed.), Royer Monique (ed.), Koebnik Ralf (ed.), Verdier Valérie (ed.). INRA, INRA-LIPM, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT, IRD. Paris : INRA, Résumé, 13. Xanthomonas genomics conference 2012. 4, Angers, France, 9 Juillet 2012/12 Juillet 2012.

The complete genome sequence of Xanthomonas albilineans provides insights into pathogenicity of this sugarcane pathogen and allows further assessments of the large diversity within this species. Pieretti Isabelle, Cociancich Stéphane, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Champoiseau Patrice, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Marguerettaz Mélanie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Valérie, Arlat Mathieu, Gabriel Dean W., Rott Philippe, Royer Monique. 2011. In : 5th European Conference on Prokaryotic and Fungal Genomics ProkaGENOMICS 2011, Göttingen, Germany, September 18-21, 2011. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. European Conference on Prokaryotic and Fungal Genomics. 5, Göttingen, Allemagne, 18 Septembre 2011/21 Septembre 2011.

Genomes of three tomato pathogens within the Ralstonia solanacearum species complex reveal significant evolutionary divergence : [O1-03, Abstract]. Remenant Benoit, Coupat-Goutaland Bénédicte, Guidot Alice, Cellier Gilles, Wicker Emmanuel, Allen Caitilyn, Fegan Mark, Pruvost Olivier, Elbaz Mounira, Calteau Alexandra, Salvignol Georges, Mornico Damien, Mangenot Sophie, Barbe Valérie, Medigue Claudine, Prior Philippe. 2010. In : Proceedings of the 12th International Conference on Plant Pathogenic Bacteria : programme, abstracts, list of participants. INRA, Université de la Réunion, IRD. s.l. : s.n., Résumé, 19. International Conference on Plant Pathogenic Bacteria. 12, Saint-Denis, Réunion, 7 Juin 2010/11 Juin 2010.

Séquençage de trois nouvelles souches du complexe d'espèces Ralstonia solanacearum : pangénome et génomique comparative. Remenant Benoit, Coupat-Goutaland Bénédicte, Cellier Gilles, Guidot Alice, Wicker Emmanuel, Mangenot Sophie, Barbe Valérie, Medigue Claudine, Prior Philippe. 2010. In : Neuvièmes Rencontres plantes-bactéries, 18-22 janvier 2010, Aussois (France) : résumés. SFP, IRD. Paris : SFP, Résumé, 32. Rencontres plantes-bactéries. 9, Aussois, France, 18 Janvier 2010/22 Janvier 2010.

La séquence complète du génome de Xanthomonas albilineans apporte un éclairage nouveau sur l'évolution des Xanthomonadaceae dont l'habitat est limité au xylème. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Valérie, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2009. In : Phytopathologie 2009. 7ème Colloque National de la Société Française de Phytopathologie, 8 au 11 Juin 2009, Lyon, France : livre des résumés. SFP, Université Claude Bernard Lyon 1. Paris : SFP, Résumé, 90. Colloque National de la Société Française de Phytopathologie. 7, Lyon, France, 8 Juin 2009/11 Juin 2009.

La séquence du génome de Xanthomonas albilineans dévoile des particularités surprenantes chez cette bactérie pathogène de la canne à sucre. Pieretti Isabelle, Royer Monique, Barbe Valérie, Carrère Sébastien, Koebnik Ralf, Cociancich Stéphane, Couloux Arnaud, Darrasse Armelle, Gouzy Jérôme, Jacques Marie Agnès, Lauber Emmanuelle, Manceau Charles, Mangenot Sophie, Poussier Stéphane, Segurens Béatrice, Szurek Boris, Verdier Véronique, Arlat Mathieu, Rott Philippe. 2008. In : 8èmes Rencontres plantes-bactéries,14-18 janvier 2008, Aussois, France. s.l. : s.n., 11. Rencontres plantes-bactéries. 8, Aussois, France, 14 Janvier 2008/18 Janvier 2008.

The mosaic genomes of two phtosynthetic Bradyrhizobium strains do not contain canonical nodulation genes. Giraud Eric, Moulin Lionel, Avarre Jean-Christophe, Jaubert Marianne, Barbe Valérie, Béna Gilles, Cartiaux F., De Lajudie Philippe, Dreyfus Bernard, Elmerich D., Fardoux Joël, Hannibal Laure, Kojadinovic Mila, Lajus Aurélie, Mangenot Sophie, Medigue Claudine, Pignol David, Prin Yves, Rouy Zoe, Stacey Gary, Vallenet David, Vermeglio André, Vuillet Laurie, Sadowsky Michael. 2008. In : Biological nitrogen fixation : towards poverty alleviation through sustainable agriculture. Proceedings of the 15th International Nitrogen Fixation Congress and the 12th International Conference of the African Association for Biological Nitrogen Fixation. s.l. : s.n., Résumé, 1 p. International Congress on Nitrogen Fixation. 15, Cape Town, Afrique du Sud, 21 Janvier 2007/26 Janvier 2007.

Abscence de gènes nod chez certaines souches de Bradyrhizobium photosynthétiques révélée par l'analyse de la séquence de leurs génomes. Moulin Lionel, Avarre Jean-Christophe, Jaubert Marianne, Barbe Valérie, Béna Gilles, Cartiaux F., Delajudie P., Dreyfus Bernard, Elmerich D., Fardoux Joël, Hannibal L., Kojadinovic Mila, Lajus Aurélie, Mangenot S.G., Medigue Claudine, Pignol David, Prin Yves, Rouy Zoe, Stacey Gary, Sadowsky Michael, Vallenet D., Vermeglio André, Vuillet Laurie, Giraud E.. 2006. In : 7èmes Rencontres plantes-bactéries, 20-23 mars 2006, Aussois, France. Résumés. SFP. Angers : INRA, Résumé, 39. Rencontres plantes-bactéries. 7, Aussois, France, 20 Mars 2006/24 Mars 2006.