Opep. Un logiciel intégré pour l'amélioration des plantes pérennes

Baradat Philippe, Labbé Thierry. 1995. Opep. Un logiciel intégré pour l'amélioration des plantes pérennes. In : Traitements statistiques des essais de sélection : stratégies d'amélioration des plantes pérennes. CIRAD-CP. Montpellier : CIRAD-CP, 303-330. (Colloques) ISBN 2-87614-197-3 Séminaire de biométrie et de génétique quantitative, Montpellier, France, 12 Septembre 1994/14 Septembre 1994.

Autre titre : Opep. An integrated software for perennial crops breeding

Résumé : Le logiciel OPEP a été conçu pour réaliser de façon pratique et rapide la plupart des traitements biométriques envisageables dans le cadre de l'amélioration d'une esssence forestière ou d'une plante pérenne non forestière. Sa version actuelle, (langage C, Fortran 77 sous UNIX) couvre : la gestion de fichiers; la génération et gestion de dispositifs; les méthodes statistiques; la génétique quantitative; la génétique des populations. Une totale intégration des divers modules permet de réaliser, sur un même fichier, des milliers de chaînes de traitement différentes en combinant plusieurs méthodes et modèles, la vaste gamme de types d'index de sélection disponibles ainsi que le grand nombre de caractères (999) et de facteurs (99 999 avec 99 999 modalités chacun) que l'on peut traiter simultanément dans des analyses multivariables. La présence d'un analyseur syntaxique permet de définir directement, à l'aide de simples formules algébriques, n'importe quelle fonction à partir des observations stockées dans des fichiers standardisés. Ses points faibles sont la limitation des modéles d'analyse de variance que l'on peut traiter et l'absence de prise en compte de la norme X-Windows (graphiques réalisés en mode alphanumérique), OPEP n'intègre pas, de méthodes du maximum de vraisemblance

Mots-clés Agrovoc : génétique, biométrie, logiciel, sélection, informatique

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
U10 - Informatique, mathématiques et statistiques

Auteurs et affiliations

• Baradat Philippe
• Labbé Thierry, INRA (FRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/464083/)

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