A distance measure between plant architectures

Ferraro Pascal, Godin Christophe. 2000. A distance measure between plant architectures. Annals of Forest Science, 57 (5-6) : 445-461.

https://doi.org/10.1051/forest:2000134

Article de revue ; Article de revue à facteur d'impact

Version publiée - Anglais
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Titre français : Définition d'une distance entre architectures de plantes

Résumé : Dans de nombreux domaines de la biologie (arboriculture, sylviculture, botanique), il est nécessaire d'étudier différents types de variabilité au sein d'une population de plantes. Nous proposons, dans ce papier, une méthode de comparaison des plantes basée sur une comparaison détaillée de leur architecture. Cette méthode est une adaptation d'un algorithme de comparaison d'arborescences, proposé récemment par Zhang en informatique théorique. Cet algorithme nous permet de définir une distance entre deux plantes comme le coût de la transformation de l'une en l'autre (à l'aide d'opérations élémentaires d'édition). Cette méthode est illustrée dans trois domaines d'application et elle est comparée à d'autres méthodes de quantification de la ressemblance entre plantes.

Mots-clés Agrovoc : plante, port de la plante, modèle de simulation, méthode statistique, variation génétique, taxon, hybride, distance génétique

Mots-clés complémentaires : Architecture végétale

Classification Agris : U10 - Informatique, mathématiques et statistiques
F50 - Anatomie et morphologie des plantes
F30 - Génétique et amélioration des plantes

Auteurs et affiliations