Diversité génétique des sorghos cultivés : gestion des ressources génétiques et contribution des marqueurs moléculaires à la constitution de core collections

Grenier Cécile. 2000. Diversité génétique des sorghos cultivés : gestion des ressources génétiques et contribution des marqueurs moléculaires à la constitution de core collections. Montpellier : USTL, 130 p. Thèse de doctorat : Biologie intégrative : Université des sciences et techniques du Languedoc

Encadrement : Hamon, Perla

Résumé : Adapté a la céréaliculture en conditions de sécheresse extrême, le sorgho (Sorghum bicolor (L.) Moench) est une céréale majeure pour l'agriculture des régions tropicales semi-arides. La collection de sorgho maintenue à l'ICRISAT (Inde) recense 22 473 variétés traditionnelles et pose le problème de la conservation et de l'utilisation optimale des ressources génétiques. Dans ce travail, mené en collaboration avec l'ICRISAT, nous apportons des éléments de réponse à trois questions: - Quelle diversité génétique est conservée à l'IAC ? Peut-on faciliter l'accès à la collection de ressources génétiques ? - Il est impossible de s'intéresser de manière efficace à une grande collection. Quelles stratégies peut-on utiliser pour consituter des core collections ? - Diversité prise en compte vs. diversité non prise en compte lors de l'échantillonnage, quel est l'impact de l'une sur l'autre ? Dans notre étude nous avons analysé la diversité morpho-agronomique de la collection de base de manière globale, et en fonction des races et des origines. Différentes stratégies de prélèvement aléatoires (C, P et L) et non aléatoires (PCS et multi-critères) ont été appliquées. Les core collections obtenues ont été comparées en fonction de la diversité morphoagronomique et de la diversité moléculaire (15 locus microsatellites) retenues. A l'exception de quelques locus présentant des associations fortes avec les caractères structurant de la diversité, les diversités moléculaire et morpho-agronomique semblent relativement indépendantes. Les marqueurs moléculaires peuvent donc être des outils intéressant à considérer pour la constitution de core collections.

Mots-clés Agrovoc : Sorghum bicolor, collection botanique, ressource génétique végétale, variation génétique, marqueur génétique, échantillonnage, microsatellite, conservation du matériel génétique

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes

Auteurs et affiliations

• Grenier Cécile, CIRAD-CA-CALIM (FRA) ORCID: 0000-0001-5390-8344

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/476145/)

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