Approche gènes candidats fonctionnels appliquée à la voie de biosynthèse des lignines dans un croisement entre E. urophylla et E. grandis

Boudet Christine. 2000. Approche gènes candidats fonctionnels appliquée à la voie de biosynthèse des lignines dans un croisement entre E. urophylla et E. grandis. Paris : Université de Paris VII, 75 p. Mémoire DESS : Productivité végétale : Université de Paris VII

Résumé : L'objectif de ce travail est d'étudier les colocalisations gènes-QTL (Quantitative Trait Locus) pour des caractères de qualité du bois au sein d'une famille élite d'Eucalyptus. L'étude porte sur une famille pleins frères de 201 arbres issus du croisement interspécifique E. urophylla x E. grandis. L'utilisation de la technique SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism) a permis de positionner cinq gènes fonctionnels sur les cartes génétiques parentales établies à partir de marqueurs RAPD. Parmi ces cinq gènes, quatre interviennent au niveau de la voie de biosynthèse des lignines (dont huit gènes ont déjà été cartographiés) : cinnamate 4-hydroxylase (gène de structure) et trois gènes de régulation (MYB). Un dernier gène a été positionné, le gène Leafy qui intervient dans le développement floral. Ces gènes se localisent sur différentes régions génomiques. La détection de QTL a été réalisée sur des caractères de croissance, de forme, de propriétés mécaniques et chimiques du bois. Un total de 12 colocalisations gènes-QTL a été observé. Les résultats montrent des effets importants de la variabilité allélique des gènes de la voie de biosynthèse des lignines sur la teneur en lignines et le rapport S/G. L'approche gènes candidats comme alternative à la transgenèse semble donc appropriée pour explorer et mettre à profit la variabilité naturelle des gènes contrôlant tout ou une partie des caractères agronomiques d'intérêt. Ainsi les connaissances acquises sur ces QTL permettraient de les intégrer dans le programme d'amélioration de l'Eucalyptus au Congo.

Résumé (autre langue) : The aim of this work is to investigate the colocalisations gene-QTL (Quantitative Trait Locus) for wood quality traits within the Eucalyptus elite family. The study deals with full sib family of 201 trees generated from an interspecific cross E. urophylla * E. grandis. The use of the SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism) was allowed to map five fonctional genes on the parental linkage maps. Among these genes, four are involved in the biosynthesis lignins pathway (eight genes of which were already mapped) : cinnamate 4-hydroxylase (structural gene) and three regulated g enes (MYB). A last g ene has been mapped, the leafy gene which is involved in the floral development. These genes are mapped on ·different genomic regions·. The detection of QTL was carried out on growth; form, mechanical and chemical property traits. A total of twelve colocalisation gene-QTL was observed. The results show the important effects of the allelic variability of gene of the biosynthesis lignin pathway on the amount of lignin and the ratio SIG. The candidate gene approach, as an alternative to the transgenese one, appears appropriate to explore and put allelic variability of genes controlling all or part of the interesting agronomie traits to good use. So the acquired knowlegde of these QTL wil l permit to integrate them in the breeding programme of the Eucalyptus in Congo.

Auteurs et affiliations

• Boudet Christine, CIRAD-FORET-PLANTATIONS (FRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/478497/)

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