Teycheney Pierre-Yves, Laboureau Nathalie, Svanella-Dumas Laurence, Iskra Caruana Marie-Line, Foissac Xavier, Candresse Thierry.
2003. Détection du virus de la mosaïque attenuée du bananier (BanMMV) par IC-RT-PCR et étude de sa variabilité moléculaire.
In : 9ème Rencontres de virologie végétale, 2-6 février 2003, Aussois
Résumé : S'il ne provoque que rarement des symptômes en infection simple, le virus de la mosaïque atténuée du bananier (Banana mild mosaic virus, BanMMV) est en revanche responsable de nécroses foliaires importantes lorsqu'il est présent en infection mixte avec le virus de la mosaïque du concombre (Cucumber mosaic virus, CMV) et d'une accentuation de l'impact du virus de la mosaïque en tirets du bananier (Banana streak virus, BSV) lorsqu'il lui est associé. Récemment identifié [1] puis caractérisé au plan moléculaire [2], ce virus d'épidémiologie encore inconnue n'en est pas moins devenu en quelques années une contrainte virologique supplémentaire lors des échanges de matériel végétal et de la micropropagation des bananiers. L'analyse des données de séquence nucléotidique actuellement disponibles le rapproche des fovea-, carla- et potexvirus qui possèdent eux aussi des particules flexueuses à symétrie hélicoïdale et un génome ARN de polarité positive. Les techniques immunoenzymatiques de détection du BanMMV actuellement utilisées, qui font appel à des réactifs sérologiques de nature mono- ou polyclonale, s'avèrent trop peu sensibles. Afin de pallier ces problèmes, une méthode de détection par immunocapture reverse transcription PCR (IC-RT-PCR) a été développée. Elle s'appuie sur l'utilisation conjointe (i) d'un sérum polyclonal pour l'étape d'immunocapture et (ii) d'amorces dégénérées contenant des résidus inosines (développées pour la détection de tricho-, capilo- et foveavirus infectant des arbres fruitiers [3]) et permettant l'amplification d'une partie du gène codant l'ARN polymérase ARN dépendante (RdRp) lors d'une nested RT-PCR polyvalente (PDO RT-PCR). L'analyse des séquences en acides aminés correspondant au fragment amplifié de 260 nt a permis la mise en évidence d'une variabilité moléculaire pouvant atteindre 10% entre isolats provenant d'une même parcelle (collection de 461 accessions naturelles de #Musa# du CIRAD Guadeloupe). Les résultats des comparaisons effectuées avec des séquences équivalentes provenant de souches d'origines géographiques distinctes seront discutés, de même que leur signification en terme d'épidémiologie et d'évolution. (Texte intégral)
Mots-clés Agrovoc : Musa, virus des végétaux, maladie des plantes, variation génétique, technique immunoenzymatique
Mots-clés géographiques Agrovoc : Guadeloupe, France
Classification Agris : H20 - Maladies des plantes
Auteurs et affiliations
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Teycheney Pierre-Yves, CIRAD-FLHOR-BPA (GLP)
ORCID: 0000-0002-9754-0745
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Laboureau Nathalie, CIRAD-FLHOR-BPA (FRA) ORCID: 0000-0002-0105-3919
- Svanella-Dumas Laurence, INRA (FRA)
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Iskra Caruana Marie-Line, CIRAD-AMIS-PROTECTION DES CULTURES (FRA) ORCID: 0000-0003-4486-2449
- Foissac Xavier, INRA (FRA)
- Candresse Thierry, INRA (FRA)
Autres liens de la publication
Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/513218/)
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