Anthony François, Bertrand Benoît, Quiros O., Etienne Hervé, Lashermes Philippe.
2000. Diversidad genética de los cafés silvestres (Coffea arabica L.) detectada por marcadores moleculares.
In : Congreso Perspectivas y Limitaciones de la Biotecnologia en Paises en Desarollo, 24-28 de enero, 2000, San José, Costa Rica. Libro de resumenes. by Romero, R.M., Hernandez, A. and Solano, G. (eds.)
Résumé : Por primera vez en el mundo se estudió la diversidad genética disponible en uno de los más grandes germoplasmas de café silvestre (Coffea arabica L.) por marcadores neutros. Se analizaron 89 accesiones de café silvestre, recolectadas en el centro de origen de la especie (Etiopía) por la FAO (1) y el IRD (ex ORSTOM) (2), seis cultivares de Etiopía, y dos cultivares tradicionales de Typica y Bourbon, utilizando los marcadores moleculares RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). El material vegetal se recolectó en el germoplasma del CATIE. Se aisló el ADN por el método de CTAB (3), con modificaciones menores. Se realizaron las amplificaciones de ADN en un volúmen de 25 [mu]l con aproximadamente 10 ng de ADN genómico, 150 [mu]M de cada dATP, dCTP, dGTP and dTTP, 12 mM de Tris-HCI (pH 8.3), 60 mM de KCI, 1.8 mM de MgC12, 0.6 [mu]M de blanco de reacción y 0.75 unidades de AmpliTaq DNA polimerasa (Perkin Elmer), utilizando el siguiente programa: un ciclo inicial de desnaturalización de 4 min a 95°C, seguido por 40 ciclos de 1 min a 93°C, 1 min a 35°C y 2 min a 72°C, y por un ciclo de 7 min a 72°C. Los productos amplificados fueron separados en un gel de electroforésis a 1.8% p/v de agarosa, y coloreados en una solución de bromuro de etidio. De los 150 blancos probados, solamente 16 detectaron polimorfismos. Produjeron 29 fragmentos polimorficos, los cuales fueron utilizados para calcular el índice de similitud (4) y construir un dendrograma por el método UPGMA (Unweighted Pair-Group Method using arithmetic Averages) (5). Casi la totalidad de los marcadores fueron generados por el material silvestre. Se estructuró la diversidad genética en seis grupos: uno para cada uno de los dos cultivares tradicionales, y cuatro para el material silvestre. La composición de los grupos del material silvestre mostró una clara separación entre las accesiones del sudoeste de Etiopía, donde se cultiva el café desde hace muchos siglos, y las del sudeste de Etiopía, del otro lado de la fosa tectónica, llamada "The Great Rift Valley". Los cultivares de Etiopía presentaron una gran diversidad, clasificándose en todos los grupos. Los resultados muestran el interés de los materiales silvestre para enriquecer la base genética del material cultivado. Su valor hace necesario la definición de una estrategia para asegurar las condiciones de conservación a largo plazo. (Texte intégral)
Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
U30 - Méthodes de recherche
Auteurs et affiliations
- Anthony François, CATIE (CRI)
-
Bertrand Benoît, CIRAD-CP-CAFE (CRI)
ORCID: 0000-0003-1969-3479
- Quiros O., CATIE (CRI)
-
Etienne Hervé, CIRAD-CP-CAFE (CRI) ORCID: 0000-0002-6208-9982
- Lashermes Philippe, IRD (FRA)
Autres liens de la publication
Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/526183/)
[ Page générée et mise en cache le 2024-04-05 ]
