Tommasi Sébastien. 2004. Détection de QTL associés à la plasticité phénotypique de la morphogenèse précoce du riz : cas de lignées recombinantes issues d'un croisement indica/japonica soumises à une carence en phosphore et à un stress osmotique. Paris : INA-PG, 34 p. Mémoire d'ingénieur : Ingénierie de la production végétale : Institut national agronomique Paris-Grignon
Résumé : La plasticité phénotypique, capacité d'adaptation morphophysiologique aux conditions environnementales, est une composante déterminante de la phase d'installation de la culture et donc de son rendement. Notre travail avait pour objet d'analyser la plasticité phénotypique du riz (Oryza sativa L.), au travers des modifications de la répartition des assimilats entre parties aériennes et racinaires, en réponse à deux stimuli environnementaux, puis de détecter les QTL impliqués dans cette réponse pour étudier son déterminisme génétique. Cette étude s'inscrit dans un projet de recherche pluridisciplinaire visant à mieux comprendre le contrôle génétique et physiologique du développement végétatif précoce et fournir des paramètres plus fins pour la modélisation du comportement de la plante et du peuplement. Une carence en phosphore et un stress osmotique ont été utilisés pour évaluer la capacité de deux variétés parentales IR64 (indica) et Azucena (japonica) et de 174 lignées recombinantes, à modifier la répartition de leur biomasse entre parties aérienne et racinaire. Le dispositif comprend 3 traitements (optimal, carence en phosphore, stress osmotique) et 3 répétitions. Ces 2 stress ont permis de mettre en évidence une allocation des assimilats plus favorable au développement racinaire, caractéristique de la plasticité. L'analyse QTL n'a pas permis de mettre en évidence de QTL associés au rapport Root/Shoot, malgré une bonne variabilité génétique du caractère. Cependant, plusieurs QTL inductibles par les stimuli environnementaux ont été détectés. La majorité de ces QTL sont détectés dans des zones impliquées pour d'autres caractères suggérant plutôt l'intervention d'une régulation de QTL constitutifs. II serait intéressant de poursuivre l'analyse concernant le rapport Root/Shoot à l'aide de données antérieures, et essayer de préciser les QTL les plus importants dans la modification de la répartition des assimilats. Enfin, la comparaison de ces QTL à des gènes-candidats permettrait de préciser leur fonction.
Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
Auteurs et affiliations
- Tommasi Sébastien, CIRAD-CA-CALIM (FRA)
Autres liens de la publication
Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/527413/)
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