Assessing genetic diversity in a germplasm collection of kola trees (Cola nitida (Vent.) Schott and Endl.) using enzymatic markers

Sié Raoul Sylvère, N'Goran Jeanne A.K., Montagnon Christophe, Akaffou D.S., Cilas Christian, Mondeil Fanja. 2005. Assessing genetic diversity in a germplasm collection of kola trees (Cola nitida (Vent.) Schott and Endl.) using enzymatic markers. Plant Genetic Resources Newsletter (143) : 59-64.

Titre français : Evaluation de la diversité génétique dans une collection de matériel génétique de kolatiers (Cola nitida (Vent.) Schott et Endl.) en utilisant des marqueurs enzymatiques / Titre espagnol : Evaluacion de la diversidad genética en una coleccion de germoplasma de arboles de cola (Cola nitida (Vent) Schott y Endl.) empleando marcadores enzimaticos

Résumé : The genetic diversity of a germplasm collection of kola trees (Cola nitida (Vent.) Schott and Endl.) maintained in Cote d'Ivoire and consisting of accessions originating from Cote d'Ivoire, Guinea and Nigeria, was assessed using 6 en­zyme systems and 11 loci. These enzyme systems were GPI with 3 loci and 17 al­leles, PGM (2loci,4 alleles), IDH (2loci, 3 alleles), EST (l locus, 3 alleles),ACP (1 lo­cus, 2 alleles) and MDH (2 loci, 5 alleles). Nine of the 11 loci were polymorphic. A hierarchical ascendant classification (cluster analysis) revealed that the total population was structured into three ge­netically distinct and di versified groups: A, Band C. The fixation index (F) and the inbreeding coefficient within sub­population (F;) were found to be +0.20 and -0.15, respectively. The three groups (A, B and C) differ at allele f of the locus Gpi-2 and the alleles e,f and g of the locus Gpi-3. Each group is heterogeneous and contained both Ivorian, Guinean and Nigerian genotypes. The originality of these groups was confirmed by a facto­rial discriminant analysis. The results led to the conclusion that the three popula­tions studied would have had a common centre of dispersion.

Résumé (autre langue) : La diversité génétique dans une collection de matériel génétique de kolatiers (Cola nitida (Vent.) Schott et Endl.) conservée en Côte d'Ivoire et constituée d'accessions originaires de Côte d'Ivoire, Guinée et Nigeria, a été évaluée en utilisant 6 systèmes enzymatiques et 11 loci, dans lesquels GPI représente 3 loci et 17 allèles, PGM (2 loci, 4 allèles), IDH (2 loci, 3 allèles), EST (1 locus, 3 allèles), ACP (1 locus, 2 allèles) et MDH (2 loci, 5 allèles). Neuf des 11 loci sont polymorphes. Une classification hiérarchique ascendante (analyse de clusters) révèle que la population totale est structurée en trois groupes génétiquement distincts et diversifiés: A, B et C. L'indice de fixation (Es) et le coefficient d'endogamie dans les sous-populations (Fis) sont de +0,20 et -0,15, respectivement. Les trois groupes (A, B et C) diffèrent au niveau de l'allèle f du locus Gpi-2 et des allèles e, f et g du locus Gpi-3. Chaque groupe est hétérogène et contient à la fois des génotypes ivoiriens, guinéens et nigérians. L'originalité de ces groupes est confirmée par une analyse factorielle discriminante. Les résultats permettent de conclure que les trois populations étudiées ont un centre de dispersion commun.

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
U30 - Méthodes de recherche

Champ stratégique Cirad : Axe 1 (2005-2013) - Intensification écologique

Auteurs et affiliations

• Sié Raoul Sylvère, Université d'Abobo-Adjamé (CIV)
• N'Goran Jeanne A.K., CNRA (CIV)
• Montagnon Christophe, CIRAD-CP-DIR (FRA)
• Akaffou D.S., Université d'Abobo-Adjamé (CIV)
• Cilas Christian, CIRAD-CP-UPR Bioagresseurs de pérennes (FRA)
• Mondeil Fanja, Université de Cocody (CIV)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/531066/)

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