Pugh Tatiana, Fouet Olivier, Risterucci Ange-Marie, Brottier Philippe, Abouladze M., Delettrez Claire, Courtois Brigitte, Clément Didier, Larmande Pierre, N'Goran Jeanne A.K., Lanaud Claire.
2005. A new codominant marker-based cocoa linkage map : development and intergration of new microsatellite markers into cocoa linkage map. A new cocoa reference map.
In : 14th International Cocoa Research Conference. Proceedings : rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? = 14th International Cocoa Research Conference. Proccedings ; 14e Conférence internationale sur la recherche cacaoyère. Actes ; 14 Conferencia Internacional de Pesquisas em Cacau. Atas ; 14 Conferencia Internacional de Investigacion en Cacao. Actas : towards a sustainable cocoa economy - what strategies to this end ? ; vers une économie cacaoyère durable : quelles stratégies d'approche ? ; rumo a uma economia sustentavel do cacau - quais as estrategias para este fim ? ; hacia una economia sustentable del ca. CEPLAC, CRIG, MCB
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Version publiée
- Anglais
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Titre français : Développement et intégration de nouveaux marqueurs microsatellites dans une carte des liaisons génétiques. Une nouvelle carte de référence du cacao / Titre portugais : Desenvolvimento e integraçao de novos marcadores de micro-satélites no mapa de liga çao do cacau. Um novo mapa de referência do cacau / Titre espagnol : Desarrollo e integracion de nuevo s marcadores micros atelite en el mapa de enlaces del cacao, un n uev o mapa de referencia del cacao
Résumé : Deux cent vingt microsatellites nouvellement mis au point ont été produits à partir d'une banque génomique, enrichis en séquence répétée en tandem (SSR) et intégrés dans une carte de liaison moléculaire haute densité existante. Les marqueurs microsatellites (SSR) ont été couramment utilisés pour de nombreuses espèces de cultures du fait de leur abondance, de leur degré élevé de polymorphisme, de leur spécificité de locus, de leur reproductibilité, de la faible quantité d'ADN nécessaire et de leur hérédité codominante. Les microsatellites ont été cartographiés sur 135 individus issus de la même population de cartographie que celle utilisée pour établir la carte de référence. Cette descendance était issue d'un croisement entre deux clones de cacao hétérozygotes: un Upper amazon Forastero (UPA 402) et un Trinitario (UF 676). Les nouveaux marqueurs microsatellites ont été attribués aux dix groupes de liaison différents qui correspondent aux dix chromosomes gamétiques du cacao. La cartographie des nouveaux marqueurs ainsi que des microsatellites précédemment décrits a permis une couverture génomique complète des 10 chromosomes, avec une distance moyenne de 1 SSR pour 3 cM. Seuls les marqueurs codominants ont été conservés pour l'établissement de la nouvelle carte de référence du cacao. Cette nouvelle carte comprend 176 RFLP, 270 marqueurs microsatellites et 5 isoenzymes. Elle constituera un outil utile pour l'identification et la comparaison entre plusieurs descendances des régions les plus importantes dans la variation des caractères d'intérêt agronomique et pour développer des stratégies de Sélection assistée par marqueurs.
Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
Auteurs et affiliations
- Pugh Tatiana, CIRAD-AMIS-BIOTROP (FRA)
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Fouet Olivier, CIRAD-AMIS-BIOTROP (FRA)
ORCID: 0000-0001-8547-1474
- Risterucci Ange-Marie, CIRAD-AMIS-BIOTROP (FRA)
- Brottier Philippe, Centre national de séquençage (FRA)
- Abouladze M.
- Delettrez Claire
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Courtois Brigitte, CIRAD-AMIS-BIOTROP (FRA) ORCID: 0000-0003-2118-7102
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Clément Didier, CIRAD-CP-CACAO (FRA) ORCID: 0000-0002-7602-6472
- Larmande Pierre, CIRAD-AMIS-BIOTROP (FRA)
- N'Goran Jeanne A.K., CNRA (CIV)
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Lanaud Claire, CIRAD-AMIS-BIOTROP (FRA) ORCID: 0000-0001-6411-7310
Autres liens de la publication
Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/533905/)
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