Dynamique spatio-temporelle de l'anthracnose des baies du caféier arabica due à Colletotrichum kahawae [Waller & Bridge], au Cameroun : analyse des principaux facteurs déterminants de la maladie

Mouen Bedimo Joseph Aubert. 2006. Dynamique spatio-temporelle de l'anthracnose des baies du caféier arabica due à Colletotrichum kahawae [Waller & Bridge], au Cameroun : analyse des principaux facteurs déterminants de la maladie. Montpellier : ENSAM, 112 p. Thèse de doctorat : Ressources phytogénétiques et interactions biologiques : Ecole nationale supérieure agronomique de Montpellier

Titre anglais : Spatio-temporal dynamics of arabica coffee berry disease caused by Colletotrichum kahawae [Waller & Bridge], in Cameroon : Analysis of the main determinant factors on the disease

Encadrement : Nottéghem, Jean-Loup

Résumé : Coffee Berry Disease (CBD), caused by Colletotrichum kahawae, is a major constraint for arabica (Coffea arabica L.) coffee growing in the major production zones of Africa. The disease is specific to green berries and can lead to 60% harvest losses under conditions that are particularly propitious to the disease. Better knowledge of how epidemics develop would make it possible to optimize control methods. The dynamics of pathogen/host/environment interactions were studied taking an experimental approach at two sites with a high disease incidence in Cameroon. The study of CBD spatio-temporal dynamics revealed that epidemics evolved over time following a logistic model and that their spatial spread could take place from infection foci. Such foci appeared one to two weeks after the start of the disease and faded at the moment of maximum disease spread, during the exponential phase. Experiments conducted to check hypotheses on the origin of those infection foci brought out the factors that govern CBD epidemics. Disease severity was negatively correlated to temperatures; berries were virtually uninfected in the absence of rainfall. Lastly, primary inoculum and allo-inoculum pressure were decisive in the way CBD epidemics progressed. Our work lays the foundations for a clearer understanding of the spatio-temporal spread of this disease. Maintenance pruning, the destruction of mummified berries and coffee tree shading create environmental conditions that help to limit CBD development. Agricultural practices that reduce the amount of primary inoculum and reduce the growth and/or dispersal of the pathogen can be considered for effective CBD control.

Résumé (autre langue) : L'anthracnose des baies ou Coffee Berry Disease (CBD), due à Colletotrichum kahawae constitue une importante contrainte pour la culture du caféier arabica (Coffea arabica L.), dans les grandes zones de production d'Afrique. Cette maladie est spécifique des baies vertes et peut entraîner environ 60% de pertes de récoltes, dans les conditions particulièrement favorables la maladie. Une meilleure connaissance des modalités de développement des épidémies, permettrait d'optimiser les méthodes de lutte. La dynamique des interactions entre l'agent pathogène, son hôte et l'environnement, ont été étudiées par une approche expérimentale, sur deux sites à forte incidence de la maladie au Cameroun. L'étude de la dynamique spatio-temporelle du CBD a montré que les épidémies évoluent au cours du temps suivant un modèle logistique et que leur progression spatiale peut se faire à partir des foyers d'infection. Ces foyers apparaissent une à deux semaines après le début de Ia maladie et s'estompent au moment de sa progression maximale, lors de la phase exponentielle. Les expérimentations conduites pour vérifier les hypothèses sur l'origine de ces foyers d'infection, ont permis de déterminer les facteurs régissant les épidémies de CBD. La sévérité de la maladie est négativement corrélée aux températures; les baies ne sont quasiment pas infectées en l'absence des pluies. Enfin, la pression de l'inoculum primaire et l'allo-inoculum sont déterminants dans le déroulement des épidémies de CBD. Nos travaux permettent de poser les bases d'une meilleure compréhension de la progression spatio-temporelle de cette maladie. La taille d'entretien, la destruction des baies momifiées et l'ombrage des caféiers créent des conditions environnementales permettant de limiter le développement du CBD. Les pratiques agricoles qui réduisent la quantité d'inoculum primaire et qui réduisent la croissance et/ou la dispersion de l'agent pathogène peuvent être envisagés pour un contrôle efficace du CBD.

Classification Agris : H20 - Maladies des plantes

Champ stratégique Cirad : Axe 1 (2005-2013) - Intensification écologique

Auteurs et affiliations

• Mouen Bedimo Joseph Aubert, ENSAM [Ecole nationale supérieure agronomique de Montpellier] (FRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/536268/)

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