Alpizar Edgardo. 2006. Etude de la résistance du Coffea arabica au nématode Meloidogyne exigua conférée par le gène Mex-1 et mise au point des outils pour son analyse fonctionnelle. Montpellier : ENSAM, 134 p. Thèse de doctorat : Sciences. Génomique et amélioration des plantes : Ecole nationale supérieure agronomique de Montpellier
Titre anglais : Study of the resistance of Coffea arabica to Meloidogyne exigua root-knot nematode conferred by the Mex-1 gene and development of tools for its functional analysis
Encadrement : Lashermes, Philippe
Résumé : En Amérique Latine, les nématodes à galles (Meloidogyne sp.) sont des parasites fréquents sur les racines des caféiers (Coffea arabica) et provoquent des baisses de rendement importantes. Concernant Meloidogyne exigua, la lutte génétique consiste à introgresser dans les variétés cultivées des gènes de résistance (gènes R) provenant de l'espèce C. canephora. Le gène nommé Mex-1, identifié récemment est en cours de clonage. Cette thèse avait pour objectif de développer des outils (transgénèse et "bio-essais") pour réaliser la validation fonctionnelle des gènes candidats de résistance à M. exigua. Différentes expérimentations en pépinière et en champs ont permis de prouver que l'expression du gène Mex-1 pouvait être dominant incomplète. Une méthode de transformation basée sur l'utilisation d'Agrobacterium rhizogenes, a été mise au point permettant la régénération rapide et efficace de racines transformées sur des hypocotyles d'embryons zygotiques et la production consécutive de plantes composites co-transformées (50-60%) sur lesquelles peuvent être appliqués les tests de résistance au nématode en conditions contrôlées. Les conditions d'entretien à long terme des racines transformées 'Hairy roots' ont été définies. La caractérisation morphologique de 62 dones transformés a permis l'identification de deux phénotypes altérés. L'utilisation des gènes rapporteurs gus et gfp a permis une sélection visuelle des racines transformées et a également permis de préciser le mode et la stabilité de l'expression du promoteur CaMV35S au niveau racinaire. Les résultats sont discutés pour apprécier l'efficacité des outils développés et la stratégie pour la validation fonctionnelle du gène Mex-1. L'exploitation de cet outil est également envisagée pour l'analyse fonctionnelle d'autres gènes de résistance aux nématodes à galles, ou bien de gènes de résistance aux stress abiotiques (sécheresse) ou impliqués dans le développement de la racine.
Classification Agris : H10 - Ravageurs des plantes
F30 - Génétique et amélioration des plantes
U30 - Méthodes de recherche
Champ stratégique Cirad : Axe 1 (2005-2013) - Intensification écologique
Auteurs et affiliations
- Alpizar Edgardo, CIRAD-CP-UMR DGPC (FRA)
Autres liens de la publication
Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/536599/)
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