Caractérisation du déséquilibre de liaison chez le palmier à huile (Elaeis guineensis Jacq.)

Soler Clélia. 2009. Caractérisation du déséquilibre de liaison chez le palmier à huile (Elaeis guineensis Jacq.). Montpellier : CIRAD, 44 p. Mémoire de master 2 : Biologie, agronomie, environnement. Biologie fonctionnelle des plantes : Université Montpellier 2

Résumé : Pour Identifier des locus associés à des caractères agronomiques par génétique d'association, Il est utile, au préalable, d'étudier l'étendue du Déséquilibre de Liaison (DL) entre deux locus afin de s'assurer que deux marqueurs, ou un marqueur et le caractère phénotypique soient bien associées. Dans cette étude, menée sur l'espèce Elaeis guineensis Jacq. 23 marqueurs SSR microsatellites ont été choisis sur les groupes de liaison (GL) GL8 et GL15 qui représente des segments respectivement de 135.2 et 80.9 cM de long. La caractérisation du DL a été entreprise sur 3 origines améliorées de palmier à huile: La Mé (Côte d'Ivoire), Yangambi (République Démocratique du Congo) et Deli (Malaisie). La légitimité de la population et sa structure ont été analysés avant de caractériser le DL La structure du matériel étudié est divisé en 3 origines. Ce résultat est identique à celui mise en évidence lors de l'étude de la diversité génétique entrepris par Cochard (2008). L'étendue du DL varie suivant les GL et les origines (entre 9 et 42 cM). Les données récoltés lors de cette étude permettent de définir le nombre de marqueurs nécessaires à la recherche de QTL dans le cadre d'une approche genomescan. Ce qui permettra par la suite d'identifier des réglons d'intérêt par une étude de génétique d'association.

Mots-clés Agrovoc : Elaeis guineensis

Mots-clés géographiques Agrovoc : Côte d'Ivoire, Bénin

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes

Auteurs et affiliations

• Soler Clélia, CIRAD-BIOS-UPR Génétique palmier (FRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/551032/)

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