Identificação de SNPs na população F2 SCA6 x ICS1para obtençao de marcas associadas à resistência do cacaueiro a vassoura-de-bruxa : [Resumo]

Lemos L.S.L., Gramacho Karina Peres, Santos Rogério M.F., Clément Didier, Santos S.F., Ganem Rodrigo Sousa, Lima L., Sousa L.A., Braz Nara G.R., Gesteira Abelmon S., Pires José Luis, Micheli Fabienne. 2010. Identificação de SNPs na população F2 SCA6 x ICS1para obtençao de marcas associadas à resistência do cacaueiro a vassoura-de-bruxa : [Resumo]. In : Resumos do 56° Congresso Brasileiro de Genética, 14 a 17 de setembro de 2010, Guaruja, Brasil. Sociedade Brasileira de Genética. s.l. : s.n., 171. Congresso Brasileiro de Genética. 56, Guaruja, Brésil, 14 Septembre 2010/17 Septembre 2010.

Résumé : A vassoura-de-bruxa causada pelo fungo #Moniliophthora perniciosa# é a doença de maior impacto na cacauicultura no Brasil. Sua principal forma de controle é a utilização de clones resistentes, porém é preciso aumentar a base genética nos plantios comerciais para que se tenha uma resistência mais duradoura. O principal objetivo do Programa de Melhoramento do Cacaueiro do CEPEC/CEPLAC é a piramidação de diferentes genes de resistência, visando aumentar a eficiência e a durabilidade da resistência (PIRES et al., 1996). O objetivo deste estudo foi a busca de polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNPs) em genes de resistência a vassoura-de-bruxa, com o intuito de aplicar o mais diretamente possível o resultado dos estudos moleculares à seleção de cacaueiros duravelmente resistentes a M. perniciosa. Os SNPs são resultantes de mutações pontuais e se definem como um loco para o qual encontramos dois alelos em uma freqüência mínima de 1%. A partir de 153 genes de resistência identificados na biblioteca de TSH1188, foram desenhados 73 primers para identificação e validação de SNPs na população F2 SCA6 x ICS1 por seqüenciamento do produto de PCR amplificado. Inicialmente foi feita à otimização da temperatura de 38 primers. Esses primers foram amplificados e seqüenciados nos progenitores SCA6 e ICS1, na F1 TSH516 e no TSH1188. Dos 38 primers,16 foram seqüenciados, sendo 9 monomórficos e 7 polimórficos. O resultado do seqüenciamento foi analisado através do programa CLUSTAL W, onde foi possível a obtenção de 286 SNPs; uma proporção de aproximadamente 51 SNPs para cada gene de resistência onde foi detectado SNP. Foram encontrados SNPs em importantes genes de defesa, como o Cf9_Rapidly Elicited protein, Disease resistance protein, Beta 1,3 - glucanase, e o maior numero de SNPs foi encontrado no gene Pathogenesis-related protein 4B, com 112 SNPs. Este resultado é bastante promissor considerando que SNPs identificados por sequenciamento, normalmente já se encontram validados. Conclui-se que a identificação de SNPs em #Theobroma cacao# mostra-se uma ferramenta promissora para a geração de marcas relacionadas à resistência a vassoura-de-bruxa. (Texte intégral)

Mots-clés Agrovoc : Moniliophthora, Theobroma cacao

Mots-clés géographiques Agrovoc : Brésil

Mots-clés complémentaires : Moniliophthora perniciosa

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
H20 - Maladies des plantes

Auteurs et affiliations

• Lemos L.S.L., CEPEC (BRA)
• Gramacho Karina Peres, CEPLAC (BRA)
• Santos Rogério M.F., CEPEC (BRA)
• Clément Didier, CIRAD-BIOS-UMR DAP (BRA) ORCID: 0000-0002-7602-6472
• Santos S.F., CEPEC (BRA)
• Ganem Rodrigo Sousa, CEPEC (BRA)
• Lima L., CEPEC (BRA)
• Sousa L.A., CEPEC (BRA)
• Braz Nara G.R., CEPEC (BRA)
• Gesteira Abelmon S., UESC (BRA)
• Pires José Luis, CEPLAC (BRA)
• Micheli Fabienne, CIRAD-BIOS-UMR DAP (BRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/558714/)

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