Etude du système de sécrétion de type III de Xanthomonas albilineans, l'agent causal de l'échaudure des feuilles de la canne à sucre

Puig Jérôme. 2008. Etude du système de sécrétion de type III de Xanthomonas albilineans, l'agent causal de l'échaudure des feuilles de la canne à sucre. s.l. : UM2, 36 p. Mémoire de master professionnel : Sciences et techologies. Biologie, géosciences, agro-ressources, environnement. Biodiversité et interactions microbiennes et parasitaires : Université Montpellier 2

Encadrement : Royer, Monique

Résumé : Xanthomonas albilineans est une bactérie phytopathogène qui colonise efficacement le xylème de la canne à sucre et qui est responsable d'une maladie appelée l'échaudure des feuilles. Cette bactérie produit une toxine particulière, l'albicidine, qui bloque la différenciation des chloroplastes. Les analyses phylogénétiques montrent que X albilineans occupe une position particulière au sein des bactéries phytopathogènes, notamment au sein du genre Xanthomonas. Le séquençage récent de la souche GPE PC73 de X. albilineans a révélé la présence d'un groupement de gènes codant un système de sécrétion de type III (^^SS) de la famille SPI-1. Les TTSS SPI-1 permettent l'injection d'effecteurs protéiques dans des cellules animales et ils sont presque exclusivement présents chez les bactéries pathogènes de l'homme ou symbiontes d'insectes. L'objectif de ce stage était de contribuer à l'étude du rôle du TTSS SPI-1 de X albilineans dans le cycle de vie de la bactérie, sachant qu'aucune interaction de X albilineans avec un hôte animal n'a jamais été décrite à ce jour. Dans un premier temps nous avons étudié la variabilité des gènes codant le TTSS SPI-1 au sein des souches de X. albilineans. Pour cela, nous avons amplifié par PCR et séquence la totalité du groupement de gène TTSS SPI-1 de la souche Xa23R1 de X albilineans qui appartient à un autre groupe génotypique que la souche GPE PC73 et dont la séquence du groupement des gènes de biosynthèse de l'albicidine (XALB 1) est connue. Les analyses comparatives des séquences du TTSS SPI-1 et de XALB1 montrent que ces deux groupements de gènes évoluent sous une sélection purificatrice liée au maintien de la fonction des gènes. Ce résultat suggère fortement que les gènes du TTSS SPI-1 sont exprimés chez X albilineans. Dans un deuxième temps nous sommes intéressés à l'induction du promoteur responsable de l'activation de la transcription des gènes du TTSS SP-1 afin de démontrer que ce promoteur est fonctionnel et afin de contribuer à l'identification du rôle du ^^SS SPI-1 dans le cycle de vie de X albilineans. Malheureusement aucune des conditions expérimentales testées n'a permis de mettre en évidence une induction de ce promoteur. Ce rapport propose également plusieurs hypothèses concernant le rôle du TTSS SPI-1 dans le cycle de vie de X albilineans.

Mots-clés Agrovoc : Saccharum officinarum, Xanthomonas albilineans, toxine bactérienne

Mots-clés complémentaires : Albicidine

Classification Agris : H20 - Maladies des plantes

Auteurs et affiliations

• Puig Jérôme, CIRAD-BIOS-UMR BGPI (FRA)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/563775/)

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