Rôle des effecteurs de type III dans l'interaction Ralstonia solanacearum/aubergine : approches de génétique évolutive et fonctionnelle

Sujeeun Lakshmi. 2014. Rôle des effecteurs de type III dans l'interaction Ralstonia solanacearum/aubergine : approches de génétique évolutive et fonctionnelle. Saint-Denis : Université de la Réunion, 93 p. Mémoire de master 2 : Biodiversité et écosystèmes tropicaux : Université de la Réunion

Résumé : Ralstonia solanacearum est une Béta-protéobactérie à la taxonomie complexe capable d'infecter 250 espèces hôtes et responsable du flétrissement bactérien. Pour évaluer la durabilité de résistance aux Solanacées, il semble important de comprendre le rôle des effecteurs de type 3 (ET3), déterminants majeurs de la virulence de la bactérie dans le contournement ou l'activation de la résistance des plantes. Cette étude consiste à mettre en évidence les effecteurs impliqués dans la spécificité de virulence sur aubergine. Dix ET3 putativement associés à la virulence ont été amplifiés par PCR (Polymerase Chain Reaction) et séquencés dans une collection de 91 souches bactériennes. Huit gènes de ménages ont aussi été amplifiés et séquencés afin de reconstruire la phylogénie des souches étudiées. Les phylogénies construites à partir de ces huit gènes ont été comparées à celle établies sur les effecteurs. Vingt souches représentatives de la diversité de répartition des effecteurs ont été sélectionnées pour une inoculation en conditions contrôlées sur des cultivars d'aubergines résistants E6 et sensible E8. Six mutants défectifs ont également été inoculés sur E6 et E8 pour estimer leur implication dans l'avirulence sur E6. Les résultats obtenus mettent en évidence un ET3 conservé chez toutes les souches et des ET3 à répartition variables selon les souches. La distribution des effecteurs étudiés se structure en onze profils et un polymorphisme de taille des ET3 a été détecté. Les analyses phylogénétiques révélent des cas d'incongruence pour trois effecteurs (sur cinq analysés) suggérant des évènements de recombinaison. Enfin les résultats d'inoculation des mutants montrent que cinq effecteurs pourraient être reconnus par les mécanismes de la plante conduisant à la résistance durable de E6.

Classification Agris : H20 - Maladies des plantes

Auteurs et affiliations

• Sujeeun Lakshmi, CIRAD-BIOS-UMR PVBMT (REU)

Source : Cirad - Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/573610/)

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