Identificação de novos acessos de Coffea arabica introduzidos na coleção da Etiópia do IAPAR

Vecchia Ferreira Rafaelle, Andrade Giselly, Charmetant Pierre, Leroy Thierry, Silva Domingues Douglas, Protasio Pereira Luiz Filipe. 2015. Identificação de novos acessos de Coffea arabica introduzidos na coleção da Etiópia do IAPAR. In : Anais do IX Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil. Consórcio Pesquisa Café. Curitiba : Consórcio Pesquisa Café, 5 p. Simpósio de Pesquisa dos Cafés do Brasil. 9, Curitiba, Brésil, 24 Juin 2015/26 Juin 2015.

Titre anglais : Identification of new acces of Coffea arabica introduced into the Ethiopa collection from IAPAR

Résumé : Marcadores microssatélites foram utilizados na discriminação de novos acessos de Coffea arabica que foram introduzidos na coleção da Etiópia do IAPAR, provenientes de uma coleção similar na República de Camarões. Inicialmente 46 acessos de Camarões foram repassados para a Embrapa CPAC (Embrapa Cerrados – Planaltina-DF), onde ficaram em quarentena. Em seguida, estes acessos foram transferidos para o IAPAR, porém durante os processos de quarentena e transferência, alguns dos acessos foram misturados. Visando identificar corretamente os acessos e também validar os SSRs previamente identificados, todos os 46 acessos foram analisados em géis de poliacrilamida. Os 8 locos microssatélites utilizados geraram um total de 19 alelos, com uma média de 2,3 alelos por loco. A variação alélica foi de 2 a 3 alelos por loco. Para realizar as análises de divergência genética uma matriz de distância foi computada e utilizada para obter uma árvore (dendograma) de diversidade global. Observou-se 3 diferentes agrupamentos entre os acessos ET34, Java e ET19. A análise genotípica dos diferentes locos microssatélites indicou quais acessos corresponderiam corretamente a ET34, Java ou ET19, já que este último teve o papel de controle positivo. Os marcadores microssatélites foram eficientes para discriminar os acessos de C. arabica provenientes de Camarões e o número de locos utilizado (8) também foi suficiente para a separação entre os acessos com seus respectivos genótipos.

Résumé (autre langue) : Microsatellite markers were used in discrimination of new access of Coffea arabica which were introduced in the collection of Ethiopia IAPAR, from a similar collection in Cameroon. Initially 46 Cameroon accesses were transferred to Embrapa CPAC (Embrapa Cerrados – Planaltina-DF), where they were quarantined. Then these accessions were transferred to the IAPAR, but during the quarantine and transfer processes, some of the accesses were mixed. To identify the accesses correctly and validating the previously identified SSRs, all 46 accesses were analyzed on polyacrylamide gels. The 8 microsatellite loci used generated a total of 19 alleles, with an average of 2.3 alleles per locus. Allelic variation was 2 to 3 alleles per locus. To perform the analysis of genetic divergence a distance matrix was computed and used for a diversity of overall tree (dendrogram). There were 3 different groups between ET34 access, Java and ET19. Genotypic analysis of different microsatellite loci indicated which accesses correctly correspond to ET34, ET19 or Java, since this latter has the role positive control. Microsatellite markers were efficient to discriminate the C. arabica accessions from Cameroon and the number of loci used (8) is also sufficient for the separation between accesses to their respective genotype.

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
U30 - Méthodes de recherche

Auteurs et affiliations

• Vecchia Ferreira Rafaelle, CAPES [Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior] (BRA)
• Andrade Giselly, IAPAR (BRA)
• Charmetant Pierre, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA) ORCID: 0000-0003-0346-9202
• Leroy Thierry, CIRAD-BIOS-UMR AGAP (FRA)
• Silva Domingues Douglas, IAPAR (BRA)
• Protasio Pereira Luiz Filipe, EMBRAPA (BRA)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/576597/)

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