Cartographie génétique de gènes candidats pour la qualité du bois chez l'Eucalyptus

Carrouché Audrey. 2003. Cartographie génétique de gènes candidats pour la qualité du bois chez l'Eucalyptus. Toulouse : Université de Toulouse III, 54 p. Mémoire DESS : Biotechnologies végétales : Université Toulouse 3 - Paul Sabatier

Encadrement : Gion, Jean-Marc

Résumé : Dans le cadre du programme d'amélioration génétique des eucalyptus au Congo, des travaux de cartographie génétique et de détection de QTL (Quantitative Trait Loci) pour la qualité du bois ont été entrepris depuis plusieurs années. Une approche gène candidat a récemment été mise en place avec des résultats encourageants pour les gènes de la voie de biosynthèse des lignines. L'objectif de cette étude est de posi­tionner des étiquettes de gènes exprimés (EST) sur les cartes génétiques d'Eucalyptus urophylla et E. grandis déjà existantes et de tester l'association entre leur variabi­lité moléculaire et la variation de caractères de qualité du bois. Pour 34 EST d'E.gunnii, des amorces spécifiques ont été définies, et après optimisation des conditions d'amplification, la détection du polymorphisme au sein des fragments exploitables a été réalisée par SSCP (Single Strand Conformation Polymorphism). Au total, 14 EST polymorphes ont été cartographiées et une recherche de QTL a été effectuée. Parmi ces EST, 8 colocalisations avec des QTL de qualité du bois ont été mises en évidence. Même si ces résultats demandent à être précisés (effectif plus important pour les analyses) et validés au niveau des populations d'amélioration, ces résultats sont prometteurs pour envisager une sélection assistée par marqueurs pour la qualité du bois.

Résumé (autre langue) : Genetic mapping and quantitative trait loci (QTL) analyses for wood quality have been conducted within the framework of the eucalyptus breeding programme in Congo. Recently, a candidate gene approach has been developed and good results were obtained for genes involved in lignin biosynthesis. The aim of the current study is first to map expressed sequence tags (EST) on the genetic maps of Eucalyptus urophylla and E. grandis, then to test effects of the genetic variability of candidate genes on the wood quality trait variation. Specific primers were designed for 34 EST of E. gunnii and after optimizing amplification conditions, the detection of polymorphism was realized using the Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP) technic. A number of 14 EST were mapped and used for QTL analyses. Finally, 8 colocalisations between wood quality traits and EST were found. Even if these results need to be precised (analysis of larger sample) and validated by the study of gene effects within breeding populations, they open up new perspectives for markers assisted selection for wood quality.

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
K10 - Production forestière
K50 - Technologie des produits forestiers
F50 - Anatomie et morphologie des plantes

Auteurs et affiliations

• Carrouché Audrey, Université Toulouse III Paul Sabatier (FRA)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/577629/)

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