Biométrie et informatique. Rapport de mission en Côte d'Ivoire (du 5 au 23 février 1991). Station de La Mé, plantation expérimentale Robert Michaux, station cocotier Marc Delorme

Bonnot François. 1991. Biométrie et informatique. Rapport de mission en Côte d'Ivoire (du 5 au 23 février 1991). Station de La Mé, plantation expérimentale Robert Michaux, station cocotier Marc Delorme. Paris : CIRAD-IRHO, 31 p. N° de rapport : 2342

Résumé : Cette mission en biométrie effectuée sur les 3 stations de recherches de l'IRHO en Côte d'Ivoire a permis d'aborder les problèmes de statistique et d'informatique rencontrés par les chercheurs. A La Mé, le recensement des différentes bases de données nécessaires au service Sélection a permis de déterminer les priorités de réalisation et de définir le partage des tâches entre La Mé et Montpellier. Ces bases de données concernent les F.A., les descendances créées, les géniteurs, le stock de pollen, les champs généalogiques, le parcellaire, et les analyses de régimes. L'étude avec le service Agronomie des protocoles des essais CI-CP 18 et LM-CP 31 a permis de préciser leur analyse statistique. Une étude préliminaire sera réalisée par la division Biométrie sur les données de l'essai LM-ES 326 bis. Le logiciel METEO a été installé sur le micro-ordinateur du service Agronomie et sera opérationnel lorsque les fichiers auront été créés en liaison avec la division Biométrie. En biométrie, des thèmes de recherche susceptibles d'être approfondis et d'aboutir à une thèse ont été proposés à M. OUATTARA. Les 2 principaux thèmes concernent l'optimisation du nombre de clones en mélange dans une plantation et l'optimisation des plans de croisement et des dispositifs expérimentaux en sélection végétale. Sur la Plantation Expérimentale Robert Michaux, le fonctionnement du logiciel RFP (Relevés de Fusariose en Plantation) a été examiné avec le service Phytopathologie. Le logiciel répond bien aux besoins et les améliorations souhaitées seront réalisées par la division Biométrie. L'observation des courbes d'évolution de la fusariose en extension et en replantation en fonction du temps a permis d'introduire des modèles qui devront être testés sur les données observées. Les problèmes d'expérimentation et d'analyse des données biochimiques sur les clones ont été abordés. Les logiciels STATPALM, METEO, SuperCalc, GEA, ainsi qu'une nouvelle version du logiciel DF, ont été installés sur les appareils du service Recherches. Sur la Station Cocotier Marc Delorme, divers problèmes statistiques concernant la germination du pollen, l'estimation du rendement, et la variabilité de la collection, ont été abordés avec le service Sélection. Le sujet du stage de M. N'CHO à Montpellier a été précisé. Les logiciels GEA, DF, et METEO ont fait l'objet de démonstrations avec le service Agronomie. Les problèmes d'équipement en informatique scientifique et en logiciels ont été abordés sur chaque station. Les stations sont maintenant équipées de matériel informatique suffisamment puissant pour envisager l'enregistrement et le traitement local d'une partie des données expérimentales. Le logiciel STATPALM, développé dans ce but par la division Biométrie, a été installé sur les 3 stations et des démonstrations ont été effectuées sur plusieurs expériences. Actuellement le traitement des données sur les stations en est à sa phase expérimentale et jusqu'à la campagne 1991/1992 comprise, les données continueront d'être traitées à Montpellier. Si ultérieurement la solution du traitement local des données était retenue, il faudrait envisager un renforcement de la biométrie en personnel et en matériel informatique. Dans tous les cas, l'envoi et le stockage des données de base à Montpellier resteront néanmoins nécessaires pour garantir leur fiabilité.

Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
C30 - Documentation et information
U10 - Informatique, mathématiques et statistiques
H01 - Protection des végétaux - Considérations générales
F01 - Culture des plantes

Auteurs et affiliations

• Bonnot François, CIRAD-CP-BIOMETRIE (FRA)

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/581067/)

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