Boulnemour Medhi. 2016. Développer un système de gestion des données pour le suivi des dispositifs expérimentaux agronomiques. Marseille : Aix-Marseille université, 58 p. Mémoire de master 2 : Sciences et technologie. Bioinformatique et génomique : Aix-Marseille université
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Encadrement : Auzoux, Sandrine ; Pot, David ; Rouan, Lauriane
Résumé : Mon stage de fin d'étude s'inscrit dans le cadre du projet Biomass For the Future (BFF) portant sur la thématique de l'agroécologie. Les objectifs de ce stage sont la construction d'une base de données pour stocker, sécuriser et capitaliser les données issues des différents domaines suivant : écophysiologie, météorologie, génétique, histologie, biochimie ; et le développement d'une application web permettant l'alimentation et l'interrogation de cette base de données. La première partie de ce manuscrit est dédiée à l'étude des solutions existantes pour l'intégration des données phénomiques en agronomie et la présentation des objectifs de ce stage. La seconde partie concerne les outils et l es méthodologie s mise s en oeuvre pour le développement de DAPHNE (DAtabase PHenotype plaNt intEgration), ainsi que la modélisation de cette base de données. Enfin, la dernière partie est consacré e aux différents sous-systèmes de la base de données et les fonctionnalités développées dans l'application web. DAPHNE a été conçue grâce aux systèmes de gestion de données PostgreSQL et son interface est réalisée en langage PHP à l'aide de la structure logicielle CodeIgniter.
Mots-clés libres : Données expérimentales, Observations, Données phénotypiques, Sorgho, Base de données générique, Interopérabilité, Métadonnées, Projet BFF
Classification Agris : F30 - Génétique et amélioration des plantes
C30 - Documentation et information
Auteurs et affiliations
- Boulnemour Medhi, Aix-Marseille université (FRA)
Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/584768/)
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