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Risk mapping of influenza D virus occurrence in ruminants and swine in Togo using a spatial multicriteria decision analysis approach

Fusade-Boyer Maxime, Pato Pidemnéwé S., Komlan Mathias, Dogno Koffi, Batawui Komla, Go-Maro Emilie, McKenzie Pamela, Guinat Claire, Sécula Aurélie, Paul Mathilde, Webby Richard J., Tran Annelise, Waret-Szkuta Agnès, Ducatez Mariette. 2020. Risk mapping of influenza D virus occurrence in ruminants and swine in Togo using a spatial multicriteria decision analysis approach. Viruses, 12:128, 12 p.

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Quartile : Q2, Sujet : VIROLOGY

Résumé : Influenza D virus (IDV) has been identified in several continents, with serological evidence for the virus in Africa. In order to improve the sensitivity and cost–benefit of IDV surveillance in Togo, risk maps were drawn using a spatial multicriteria decision analysis (MCDA) and experts' opinion to evaluate the relevance of sampling areas used so far. Areas at highest risk of IDV occurrence were the main cattle markets. The maps were evaluated with previous field surveillance data collected in Togo between 2017 and 2019: 1216 sera from cattle, small ruminants, and swine were screened for antibodies to IDV by hemagglutination inhibition (HI) assays. While further samples collections are needed to validate the maps, the risk maps resulting from the spatial MCDA approach generated here highlight several priority areas for IDV circulation assessment.

Mots-clés Agrovoc : influenzavirus, ruminant, porcin, surveillance épidémiologique, distribution spatiale, risque, cartographie, système d'aide à la décision

Mots-clés géographiques Agrovoc : Togo

Mots-clés libres : Influenza D virus, Togo, Risk mapping, Spatial multicriteria evaluation, Spatial multicriteria decision analysis

Classification Agris : L73 - Maladies des animaux
U30 - Méthodes de recherche

Champ stratégique Cirad : CTS 4 (2019-) - Santé des plantes, des animaux et des écosystèmes

Auteurs et affiliations

  • Fusade-Boyer Maxime, Université de Toulouse (FRA)
  • Pato Pidemnéwé S., Laboratoire Central Vétérinaire de Lomé (TGO)
  • Komlan Mathias, Laboratoire Central Vétérinaire de Lomé (TGO)
  • Dogno Koffi, Laboratoire Central Vétérinaire de Lomé (TGO)
  • Batawui Komla, Laboratoire Central Vétérinaire de Lomé (TGO)
  • Go-Maro Emilie, Laboratoire Central Vétérinaire de Lomé (TGO)
  • McKenzie Pamela, St Jude Children's Research Hospital (USA)
  • Guinat Claire, Université de Toulouse (FRA)
  • Sécula Aurélie, Université de Toulouse (FRA)
  • Paul Mathilde, Université de Toulouse (FRA)
  • Webby Richard J., St Jude Children's Research Hospital (USA)
  • Tran Annelise, CIRAD-ES-UMR TETIS (REU) ORCID: 0000-0001-5463-332X
  • Waret-Szkuta Agnès, Université de Toulouse (FRA)
  • Ducatez Mariette, ENVT (FRA) - auteur correspondant

Source : Cirad-Agritrop (https://agritrop.cirad.fr/594839/)

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